RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 E2F3O00716 465 aa17.62■□□□□ 0.41
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ACTB-201ENST00000331789 MTX2O75431 263 aa17.62■□□□□ 0.41
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ACTB-201ENST00000331789 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
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ACTB-201ENST00000331789 SUN2Q9UH99 717 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D3BA6NDS4 549 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 SPINT1O43278 529 aa17.6■□□□□ 0.41
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ACTB-201ENST00000331789 NAA20P61599 178 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 HERC3Q15034 1050 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 ACOX1Q15067 660 aa17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP17.6■□□□□ 0.411e-10■■□□□ 14.1
ACTB-201ENST00000331789 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
ACTB-201ENST00000331789 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa17.6■□□□□ 0.41
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