RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 NUP50Q9UKX7 468 aa10.47□□□□□ -0.73
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CLN8-201ENST00000331222 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
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CLN8-201ENST00000331222 GCNT1Q02742 428 aa10.46□□□□□ -0.73
CLN8-201ENST00000331222 HKDC1Q2TB90 917 aa10.46□□□□□ -0.73
CLN8-201ENST00000331222 VPS26BQ4G0F5 336 aa10.46□□□□□ -0.73
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CLN8-201ENST00000331222 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa10.46□□□□□ -0.73
CLN8-201ENST00000331222 C1orf186Q6ZWK4 172 aa10.46□□□□□ -0.73
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CLN8-201ENST00000331222 HSD11B1P28845 292 aa10.46□□□□□ -0.74
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CLN8-201ENST00000331222 MATKP42679 507 aa10.46□□□□□ -0.74
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CLN8-201ENST00000331222 ZNF510Q9Y2H8 683 aa10.46□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa10.45□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 MID1O15344 667 aa10.45□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 CLPXO76031 633 aa10.45□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 KCNJ2P63252 427 aa10.45□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 TMEM63BQ5T3F8 832 aa10.45□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 OGFOD2Q6N063 350 aa10.45□□□□□ -0.74
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