RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 FOXN2P32314 431 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 GPR33Q49SQ1 333 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 ZNF470Q6ECI4 717 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 RFLNAQ6ZTI6 216 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 NLRP8Q86W28 1048 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 SLC26A11Q86WA9 606 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 LRRC6Q86X45 466 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 CNTN4Q8IWV2 1026 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 PPM1NQ8N819 430 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 GPR150Q8NGU9 434 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 COL26A1Q96A83 441 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 ULK4Q96C45 1275 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 WBP1Q96G27 269 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 APOLD1Q96LR9 279 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 RUFY1Q96T51 708 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 DUSP23Q9BVJ7 150 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 SLC17A9Q9BYT1 436 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 ABCG4Q9H172 646 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 FZD3Q9NPG1 666 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 CRLS1Q9UJA2 301 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 IKBKGQ9Y6K9 419 aa15.76■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 CSO75390 466 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 GIMD1P0DJR0 217 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 LSSP48449 732 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 ERVPABLB-1P60509 514 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 DPTQ07507 201 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 NFATC2Q13469 925 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 LRRC14Q15048 493 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 CHRNA6Q15825 494 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 LRIG3Q6UXM1 1119 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 CERS6Q6ZMG9 384 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 KIAA0408Q6ZU52 694 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 TAS2R42Q7RTR8 314 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 FAM181AQ8N9Y4 354 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 ZNF398Q8TD17 642 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 KCNE4Q8WWG9 221 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 SCAMP4Q969E2 229 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 HIC2Q96JB3 615 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 TCF12Q99081 682 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 VPS18Q9P253 973 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 FETUBQ9UGM5 382 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa15.75■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 A6NNZ2 444 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 SCAMP1O15126 338 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 C1QAP02745 245 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 SHBGP04278 402 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 INHBAP08476 426 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 SLC1A2P43004 574 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 MSH2P43246 934 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 GPR1P46091 355 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 TTPAP49638 278 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 CLDN2P57739 230 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 RAET1GQ6H3X3 334 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 PCSK4Q6UW60 755 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 GCNT7Q6ZNI0 430 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 Q6ZSR6 202 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 CROCCP2Q86T23 111 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 CNPY4Q8N129 248 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 DENND6BQ8NEG7 585 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 MAPK15Q8TD08 544 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 PAFAH2Q99487 392 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 CPNE1Q99829 537 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 ACBD3Q9H3P7 528 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 VIPAS39Q9H9C1 493 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 SMYD2Q9NRG4 433 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 THSD1Q9NS62 852 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 SMOXQ9NWM0 555 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 DNAJC28Q9NX36 388 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 SLC24A2Q9UI40 661 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 FBXO5Q9UKT4 447 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa15.74■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa15.73■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 H3BM21 787 aa15.73■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 J3QKU1 62 aa15.73■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 K7ESM1 405 aa15.73■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 NDUFS3O75489 264 aa15.73■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 TCEA3O75764 348 aa15.73■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 PCCBP05166 539 aa15.73■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 TEAD1P28347 426 aa15.73■□□□□ 0.11
IFT20-201ENST00000322326 GP5P40197 560 aa15.73■□□□□ 0.11
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