RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 TPSD1Q9BZJ3 242 aa15.68■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 TNKS2Q9H2K2 1166 aa15.68■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 PRSS16Q9NQE7 514 aa15.68■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 SUN2Q9UH99 717 aa15.68■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa15.68■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 HS3ST2Q9Y278 367 aa15.68■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 SDHDO14521 159 aa15.67■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 PRLP01236 227 aa15.67■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 ANPEPP15144 967 aa15.67■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 AP2B1P63010 937 aa15.67■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 SNX32Q86XE0 403 aa15.67■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 FBXW8Q8N3Y1 598 aa15.67■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 PRSS33Q8NF86 280 aa15.67■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 MDGA1Q8NFP4 955 aa15.67■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 FRS2Q8WU20 508 aa15.67■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 DNAJC9Q8WXX5 260 aa15.67■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 WASF2Q9Y6W5 498 aa15.67■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 FKBP6O75344 327 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 PDE5AO76074 875 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 APBB3O95704 486 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 SP9P0CG40 484 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 GABRG2P18507 467 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP6V1C1P21283 382 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 FNTBP49356 437 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 ERFP50548 548 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 STC1P52823 247 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 MUM1Q2TAK8 710 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 CMPK2Q5EBM0 449 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 C9orf64Q5T6V5 341 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 STK40Q8N2I9 435 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 OR4K2Q8NGD2 314 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 CEP70Q8NHQ1 597 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 TM6SF2Q9BZW4 377 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 POPDC3Q9HBV1 291 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 NMRK1Q9NWW6 199 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 C2orf81A6NN90 581 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 AIM2O14862 343 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 PDHA1P08559 390 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 PRSS56P0CW18 603 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 CD1DP15813 335 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 NDUFV2P19404 249 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 SUOXP51687 545 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 TYSND1Q2T9J0 566 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 C22orf39Q6P5X5 142 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 AAGABQ6PD74 315 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 CUZD1Q86UP6 607 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 CAMKK1Q8N5S9 505 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 KYQ8NBH2 561 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 PTERQ96BW5 349 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 L3HYPDHQ96EM0 354 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 FBXO4Q9UKT5 387 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 INVSQ9Y283 1065 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 FIS1Q9Y3D6 152 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 RAI2Q9Y5P3 530 aa15.66■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 COQ9O75208 318 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 SMIM24O75264 130 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 TMCC1O94876 653 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 TDGF1P13385 188 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 PSMA3P25788 255 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 NUBP1P53384 320 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 HERC3Q15034 1050 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF678Q5SXM1 525 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 HPS6Q86YV9 775 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 EFCAB3Q8N7B9 438 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 PPFIBP2Q8ND30 876 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 MARK4Q96L34 752 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 MRGPRX1Q96LB2 322 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 TRMOQ9BU70 441 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 ADGRE3Q9BY15 652 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 GSTO2Q9H4Y5 243 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 ZBTB26Q9HCK0 441 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 CKAP5Q14008 2032 aa15.65■□□□□ 0.1
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 BAG2O95816 211 aa15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 NUDT2P50583 147 aa15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-201ENST00000307180 TCF15Q12870 199 aa15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms