RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299578.9

C16orf46-201, Transcript of chromosome 16 open reading frame 46, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene C16orf46, Length 1,605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf46-201ENST00000299578 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 BMPR2Q13873 1038 aa11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 FZD2Q14332 565 aa11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 INSCQ1MX18 579 aa11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 SPDYAQ5MJ70 313 aa11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 TSTD2Q5T7W7 516 aa11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ATG16L1Q676U5 607 aa11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 PDPK2PQ6A1A2 396 aa11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 NLRP9Q7RTR0 991 aa11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 PARGQ86W56 976 aa11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 HIC2Q96JB3 615 aa11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 WDR92Q96MX6 357 aa11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 EDEM2Q9BV94 578 aa11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 KIFC1Q9BW19 673 aa11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 TSSK1BQ9BXA7 367 aa11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 LGR4Q9BXB1 951 aa11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ABCF3Q9NUQ8 709 aa11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 APPL1Q9UKG1 709 aa11.79□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 CFAP73A6NFT4 308 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 CCL22O00626 93 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 PRAMEF1O95521 474 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ITGA2BP08514 1039 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 KELP23276 732 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 PLA2G5P39877 138 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 BNIP1Q12981 228 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ITGA9Q13797 1035 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 CHRNA6Q15825 494 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 HLA-BQ31612 363 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 TRIM74Q86UV6 250 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 UNC5BQ8IZJ1 945 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 OXR1Q8N573 874 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 MINDY1Q8N5J2 469 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 OR13J1Q8NGT2 312 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 OR2I1PQ8NGU4 316 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 DTX3LQ8TDB6 740 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 PEX13Q92968 403 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF778Q96MU6 729 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 TRIM55Q9BYV6 548 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 SLC13A1Q9BZW2 595 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 GAREM1Q9H706 876 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 CHRAC1Q9NRG0 131 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 PCMTD2Q9NV79 361 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 RIMKLBQ9ULI2 386 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 CEP250Q9BV73 2442 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 H7C0S8 307 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 GPR39O43194 453 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ATP5HO75947 161 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 SRP72O76094 671 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 UBOX5O94941 541 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ERVK-10P10266 1014 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ITGALP20701 1170 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 PSMA3P25788 255 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 MC4RP32245 332 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ARSDP51689 593 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 XIAPP98170 497 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 NFATC2Q13469 925 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 PEX6Q13608 980 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF423Q2M1K9 1284 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 SPRED3Q2MJR0 410 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 DOK6Q6PKX4 331 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ENPP7Q6UWV6 458 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 FITM2Q8N6M3 262 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 OR56A4Q8NGH8 313 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 C10orf82Q8WW14 230 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 GLYATL1Q969I3 302 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ISL2Q96A47 359 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 COX14Q96I36 57 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 RMDN2Q96LZ7 410 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 LRRC37BQ96QE4 947 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 VPS35Q96QK1 796 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 RBBP8Q99708 897 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 RXFP3Q9NSD7 469 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 DNAJC28Q9NX36 388 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 SIRPGQ9P1W8 387 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 KLQ9UEF7 1012 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
C16orf46-201ENST00000299578 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
C16orf46-201ENST00000299578 TMEM202A6NGA9 273 aa11.77□□□□□ -0.53
C16orf46-201ENST00000299578 DFNA5O60443 496 aa11.77□□□□□ -0.53
C16orf46-201ENST00000299578 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms