RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298466.9

SOHLH1-201, Transcript of spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOHLH1, Length 1,987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1-201ENST00000298466 PRLHRP49683 370 aa21.87■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 PMS2P54278 862 aa21.87■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 INSCQ1MX18 579 aa21.87■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 DEFB133Q30KQ1 61 aa21.87■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 CTSL3PQ5NE16 218 aa21.87■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 TAF8Q7Z7C8 310 aa21.87■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 LMNTD2Q8IXW0 634 aa21.87■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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SOHLH1-201ENST00000298466 GIMD1P0DJR0 217 aa21.86■■□□□ 1.09
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SOHLH1-201ENST00000298466 GPBAR1Q8TDU6 330 aa21.86■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa21.86■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 CEP250Q9BV73 2442 aa21.86■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 GSTA2P09210 222 aa21.85■■□□□ 1.09
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SOHLH1-201ENST00000298466 ACTR1AP61163 376 aa21.85■■□□□ 1.09
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SOHLH1-201ENST00000298466 BCL7AQ4VC05 210 aa21.85■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF549Q6P9A3 640 aa21.85■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 CYS1Q717R9 158 aa21.85■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 AMZ2Q86W34 360 aa21.85■■□□□ 1.09
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SOHLH1-201ENST00000298466 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 DCHS1Q96JQ0 3298 aa21.85■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 FAM159BA6NKW6 160 aa21.85■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 STPG1Q5TH74 334 aa21.85■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 STRA8Q7Z7C7 330 aa21.85■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 CTAGE3PQ8IX95 158 aa21.85■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa21.85■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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SOHLH1-201ENST00000298466 PFDN6O15212 129 aa21.84■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 PCDHGA12O60330 932 aa21.84■■□□□ 1.09
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SOHLH1-201ENST00000298466 AP2A2O94973 939 aa21.84■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 TRIM16O95361 564 aa21.84■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 EML2O95834 649 aa21.84■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 OR56A5P0C7T3 313 aa21.84■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 RPL10P27635 214 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 STX2P32856 288 aa21.84■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 BRD3Q15059 726 aa21.84■■□□□ 1.09
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SOHLH1-201ENST00000298466 EPB41L4BQ9H329 900 aa21.84■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 GALPQ9UBC7 116 aa21.84■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 TBC1D29Q9UFV1 150 aa21.84■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 RAB21Q9UL25 225 aa21.84■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa21.84■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 RIPK2O43353 540 aa21.83■■□□□ 1.09
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SOHLH1-201ENST00000298466 NIPSNAP2O75323 286 aa21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 FAM155BO75949 473 aa21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 CD59P13987 128 aa21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 LRP8Q14114 963 aa21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 KIAA0408Q6ZU52 694 aa21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 CFAP206Q8IYR0 622 aa21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 PPM1NQ8N819 430 aa21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 FAM46DQ8NEK8 389 aa21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 TIMM29Q9BSF4 260 aa21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 CCM2Q9BSQ5 444 aa21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 GSDMCQ9BYG8 508 aa21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 PRDM8Q9NQV8 689 aa21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 TAAR2Q9P1P5 351 aa21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 DOLKQ9UPQ8 538 aa21.83■■□□□ 1.09
SOHLH1-201ENST00000298466 TRIM38O00635 465 aa21.83■■□□□ 1.08
SOHLH1-201ENST00000298466 YKT6O15498 198 aa21.83■■□□□ 1.08
SOHLH1-201ENST00000298466 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF883P0CG24 379 aa21.83■■□□□ 1.08
SOHLH1-201ENST00000298466 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.08
SOHLH1-201ENST00000298466 PHBP35232 272 aa21.83■■□□□ 1.08
SOHLH1-201ENST00000298466 PGGT1BP53609 377 aa21.83■■□□□ 1.08
SOHLH1-201ENST00000298466 ADARP55265 1226 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
SOHLH1-201ENST00000298466 ARHGAP8P85298 464 aa21.83■■□□□ 1.08
SOHLH1-201ENST00000298466 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
SOHLH1-201ENST00000298466 EID2Q8N6I1 236 aa21.83■■□□□ 1.08
SOHLH1-201ENST00000298466 OR2L2Q8NH16 312 aa21.83■■□□□ 1.08
SOHLH1-201ENST00000298466 CDKL2Q92772 493 aa21.83■■□□□ 1.08
SOHLH1-201ENST00000298466 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
SOHLH1-201ENST00000298466 CAMK1GQ96NX5 476 aa21.83■■□□□ 1.08
SOHLH1-201ENST00000298466 DPEP2Q9H4A9 486 aa21.83■■□□□ 1.08
SOHLH1-201ENST00000298466 GNPTGQ9UJJ9 305 aa21.83■■□□□ 1.08
SOHLH1-201ENST00000298466 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa21.83■■□□□ 1.08
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