RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ESR1P03372 595 aa23.54■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SERPINE1P05121 402 aa23.54■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GRK2P25098 689 aa23.54■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGFALSP35858 605 aa23.54■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CXCL12P48061 93 aa23.54■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AGERQ15109 404 aa23.54■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa23.54■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TSSK4Q6SA08 328 aa23.54■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC91Q7Z6B0 441 aa23.54■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HEATR4Q86WZ0 1026 aa23.54■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR174Q9BXC1 333 aa23.54■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USP34Q70CQ2 3546 aa23.54■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRC72A6NJI9 287 aa23.53■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR2AG2A6NM03 316 aa23.53■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 G3V2L1 256 aa23.53■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KLHL2O95198 593 aa23.53■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHRM3P20309 590 aa23.53■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NSG1P42857 185 aa23.53■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLDN2P57739 230 aa23.53■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NEK5Q6P3R8 708 aa23.53■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DEFB119Q8N690 84 aa23.53■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa23.53■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RMDN2Q96LZ7 410 aa23.53■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABCF3Q9NUQ8 709 aa23.53■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa23.53■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANKRD65E5RJM6 399 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM16O95361 564 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MSH3P20585 1137 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CTSCP53634 463 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NLRP8Q86W28 1048 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RFWD2Q8NHY2 731 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NXNL1Q96CM4 212 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SCYL1Q96KG9 808 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR78Q96P69 363 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPAMQ9HCL2 828 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GNPTGQ9UJJ9 305 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EML5Q05BV3 1969 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RALBP11234 206 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CD6P30203 668 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAP7D1Q3KQU3 841 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PAQR3Q6TCH7 311 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM69Q86WT6 500 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CRLF3Q8IUI8 442 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM151AQ8N4L1 468 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DCUN1D1Q96GG9 259 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa23.52■■□□□ 1.36
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C10orf142B7Z368 130 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 H0Y8X5 98 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGHV4-34P06331 123 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYL2P10916 166 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLCN7P51798 805 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDK3Q00526 305 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LDLRAP1Q5SW96 308 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DOK6Q6PKX4 331 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZYG11AQ6WRX3 759 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MACC1Q6ZN28 852 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR6Y1Q8NGX8 325 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CD200R1Q8TD46 325 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HIC2Q96JB3 615 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR2AG1Q9H205 316 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TAS2R13Q9NYV9 303 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATXN10Q9UBB4 475 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BDP1A6H8Y1 2624 aa23.51■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POM121BA6NF01 834 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 E5RI56 91 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AOC1P19801 751 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC1A6P48664 564 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CSHL1Q14406 222 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCNJ9Q92806 393 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COX14Q96I36 57 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C20orf27Q9GZN8 174 aa23.5■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DCTN4Q9UJW0 460 aa23.5■■□□□ 1.35
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