RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268673.11

PDPK1-201, Transcript of 3-phosphoinositide dependent protein kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPK1, Length 4,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPK1-201ENST00000268673 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 EDIL3O43854 480 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 BMP2P12643 396 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 PPP2R1BP30154 601 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 CRATP43155 626 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 ARSFP54793 590 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 FLCNQ8NFG4 579 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 TMEM209Q96SK2 561 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 SMOXQ9NWM0 555 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 GPC1P35052 558 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 HCAR3P49019 387 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 OR2B6P58173 313 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 CLDN10P78369 228 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 MS4A2Q01362 244 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 STARD3Q14849 445 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 ARMC12Q5T9G4 340 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 TSPEARQ8WU66 669 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 TMIGD2Q96BF3 282 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 BIRC7Q96CA5 298 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 DCSTAMPQ9H295 470 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 SP140LQ9H930 580 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 H0Y858 1186 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 GABRDO14764 452 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 PCSK2P16519 638 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 HDCP19113 662 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 HNF4AP41235 474 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 CCR10P46092 362 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 NDST2P52849 883 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 IRF8Q02556 426 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 GRM2Q14416 872 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 EPHX4Q8IUS5 362 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 TMEM159Q96B96 161 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 COPS4Q9BT78 406 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.66□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 OR56A5P0C7T3 313 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 ITIH1P19827 911 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 CTSKP43235 329 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 SPIBQ01892 262 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 NFATC3Q12968 1075 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 GALNT3Q14435 633 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 ATP6AP1Q15904 470 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 COLEC12Q5KU26 742 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 ERAP2Q6P179 960 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 TMEM174Q8WUU8 243 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 ST14Q9Y5Y6 855 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 OR4F21O95013 312 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 PAX3P23760 479 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 IL18R1Q13478 541 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 DNASE1L3Q13609 305 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 FBXL19Q6PCT2 694 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 MUS81Q96NY9 551 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 GPR21Q99679 349 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 KIFC1Q9BW19 673 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 ALS2Q96Q42 1657 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 GLDCP23378 1020 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 CPOXP36551 454 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 BRCC3P46736 316 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 SLC16A1P53985 500 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 PTCHD4Q6ZW05 846 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 HDDC2Q7Z4H3 204 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 ELMO1Q92556 727 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 CGREF1Q99674 301 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 SYT17Q9BSW7 474 aa14.65□□□□□ -0.06
PDPK1-201ENST00000268673 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms