RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223129.8

RPA3-201, Transcript of replication protein A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPA3, Length 2,020 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3-201ENST00000223129 FAM122AQ96E09 287 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 BIRC8Q96P09 236 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 GULP1Q9UBP9 304 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 ZNF292O60281 2723 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 PFDN6O15212 129 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 YKT6O15498 198 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 PCDHGA12O60330 932 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 ZNF883P0CG24 379 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 ACTR1BP42025 376 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 PMS2P54278 862 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 ACTR1AP61163 376 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 SFTPA2Q8IWL1 248 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 KRT222Q8N1A0 295 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 BTBD3Q9Y2F9 522 aa14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 FAM159BA6NKW6 160 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 AP2A2O94973 939 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 OR56A5P0C7T3 313 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 CD59P13987 128 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 NFE2L1Q14494 772 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 41.9
RPA3-201ENST00000223129 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 CYS1Q717R9 158 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 AMZ2Q86W34 360 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 EID2Q8N6I1 236 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 FAM46DQ8NEK8 389 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 FAM136AQ96C01 138 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 GSDMCQ9BYG8 508 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 NEMP2A6NFY4 417 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 LMO7DNF2Z398 122 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 SNX2O60749 519 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 SPAG6O75602 509 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 TRIM16O95361 564 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 ANXA6P08133 673 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 31.5
RPA3-201ENST00000223129 ARHGAP8P85298 464 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 LRP8Q14114 963 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 DBX2Q6ZNG2 339 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 GKN2Q86XP6 184 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 CFAP206Q8IYR0 622 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 TAAR2Q9P1P5 351 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 RABGEF1Q9UJ41 708 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.75□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 MGAT4DA6NG13 374 aa14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 TRIM38O00635 465 aa14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 NIPSNAP2O75323 286 aa14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 EML2O95834 649 aa14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 STX2P32856 288 aa14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 PHBP35232 272 aa14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 PLA2G5P39877 138 aa14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 SLC14A1Q13336 389 aa14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 BRD3Q15059 726 aa14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 XKR5Q6UX68 686 aa14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 KIAA0408Q6ZU52 694 aa14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 PPM1NQ8N819 430 aa14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 OR2L2Q8NH16 312 aa14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 CDKL2Q92772 493 aa14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa14.74□□□□□ -0.05
RPA3-201ENST00000223129 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms