RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222402.7

UBE2D4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 D4 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2D4, Length 3,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4-201ENST00000222402 PHF12Q96QT6 1004 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 OR52E6Q96RD3 313 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 RMND5AQ9H871 391 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 RNF186Q9NXI6 227 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 ETAA1Q9NY74 926 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.77□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 PTGES3LE9PB15 166 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 LRATO95237 230 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 GSNP06396 782 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 CSKP41240 450 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 DSC1Q08554 894 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 PROSER1Q86XN7 944 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 U3KQV3 271 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 SOCS2O14508 198 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 CST1P01037 141 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 G6PDP11413 515 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 MSH3P20585 1137 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 WEE1P30291 646 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 MDGA1Q8NFP4 955 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 OR10A6Q8NH74 314 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 ADGRE2Q9UHX3 823 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 CPQQ9Y646 472 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 SQORQ9Y6N5 450 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 WDR90Q96KV7 1748 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 SLC10A3P09131 477 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 GKP32189 559 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 GNPDA1P46926 289 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 KANK2Q63ZY3 851 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 TEX26Q8N6G2 289 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 PKMYT1Q99640 499 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 MGME1Q9BQP7 344 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 LRRC3Q9BY71 257 aa14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 STX16O14662 325 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 FGF4P08620 206 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 SLC6A2P23975 617 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 GABRR2P28476 465 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 CCT8P50990 548 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 KCNJ9Q92806 393 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 ZIC5Q96T25 663 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 CMTM6Q9NX76 183 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 TFAP2AP05549 437 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 C8BP07358 591 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 HID1Q8IV36 788 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 FUNDC1Q8IVP5 155 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 FBXL20Q96IG2 436 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 COPS8Q99627 209 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 ZNF696Q9H7X3 374 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 A0A1W2PQY0 241 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 C7orf72A4D263 438 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 STC2O76061 302 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 OR56A5P0C7T3 313 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 AFMIDQ63HM1 303 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 NANOGP8Q6NSW7 305 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 ITIH5Q86UX2 942 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 MINDY1Q8N5J2 469 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 ZBTB2Q8N680 514 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 GPR150Q8NGU9 434 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 AUTS2Q8WXX7 1259 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 MYEOVQ96EZ4 313 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 NANOGQ9H9S0 305 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 STK16O75716 305 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 MTHFRP42898 656 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 TXNDC8Q6A555 127 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 EID3Q8N140 333 aa14.75□□□□□ -0.05
UBE2D4-201ENST00000222402 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms