RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 CAPN1P07384 714 aa16.56■□□□□ 0.24
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CTDP1-201ENST00000075430 CA8P35219 290 aa16.56■□□□□ 0.24
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CTDP1-201ENST00000075430 ZUFSPQ96AP4 578 aa16.56■□□□□ 0.24
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CTDP1-201ENST00000075430 hCG_2039718K7EN88 272 aa16.56■□□□□ 0.24
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CTDP1-201ENST00000075430 AQP9O43315 295 aa16.55■□□□□ 0.24
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CTDP1-201ENST00000075430 XAF1Q6GPH4 301 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 AHSA2Q719I0 299 aa16.55■□□□□ 0.24
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CTDP1-201ENST00000075430 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 TIGD5Q53EQ6 642 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
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CTDP1-201ENST00000075430 MCMBPQ9BTE3 642 aa16.55■□□□□ 0.24
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CTDP1-201ENST00000075430 PRMT9Q6P2P2 845 aa16.54■□□□□ 0.24
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CTDP1-201ENST00000075430 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 UBXN10Q96LJ8 280 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 DMRTB1Q96MA1 342 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 NTN4Q9HB63 628 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 VAPAQ9P0L0 249 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 A0A1W2PQH9 124 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 SULT1C4O75897 302 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 THP07101 528 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 HSD17B1P14061 328 aa16.54■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 NEK2P51955 445 aa16.54■□□□□ 0.24
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