RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077935.5

Trps1-201, Transcript of Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trps1, Length 4,436 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1-201ENSMUST00000077935 Kcne4Q9WTW3 170 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gria3Q9Z2W9 888 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dicer1Q8R418 1916 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm45713A0A1B0GS68 446 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fam171a2A2A699 822 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lgr4A2ARI4 951 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zyg11aA2BFL2 627 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mtx3D3YTP3 312 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Got2P05202 430 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 StradaQ3UUJ4 431 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ermp1Q3UVK0 898 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 RasefQ5RI75 627 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Arhgef38Q80VK6 770 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Shc2Q8BMC3 573 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Clptm1lQ8BXA5 539 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lrrc4cQ8C031 640 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 PigwQ8C398 503 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tram1l1Q8QZR0 363 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pcdhb10Q91VE5 797 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cd209dQ91ZW8 237 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pih1d1Q9CQJ2 290 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Piwil1Q9JMB7 862 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 St6galnac4Q9R2B6 360 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ptpn4Q9WU22 926 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Entpd5Q9WUZ9 427 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mtm1Q9Z2C5 603 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm12248A0A1W2P8B8 313 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Klhdc7bA0A286YD60 1263 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pramef20B1ARV6 477 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vmn2r94E9PZK8 818 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pms2P54279 859 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pdcd1Q02242 288 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Itpripl2Q3UV16 535 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ampd1Q3V1D3 745 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Taar7eQ5QD09 358 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Taar7bQ5QD11 358 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dnajc15Q78YY6 149 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Teddm1aQ810U2 305 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fbxl4Q8BH70 621 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Q8BHN7 327 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nyap2Q8BM65 682 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Usp43Q8BUM9 1132 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Anapc2Q8BZQ7 837 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Asb14Q8C6Y6 587 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp263Q8CF60 680 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr371Q8VGB8 312 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cmc1Q9CPZ8 106 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Txndc9Q9CQ79 226 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gadd45gip1Q9CR59 222 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Serpinb1aQ9D154 379 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sun1Q9D666 913 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hao2Q9NYQ2 353 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Scn3aA2ASI5 1947 aa6.97□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tmem238lA0A1B0GS74 79 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Itga8A2ARA8 1062 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm16494E9Q2Z4 87 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 BC024978J3QPC3 361 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm3755K7N743 167 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Chil3O35744 398 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Il1rl1P14719 567 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ly6dP35459 127 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 CskP41241 450 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Aqp8P56404 261 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rps24P62849 133 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Glt6d1Q2NKH9 311 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gdpgp1Q3TLS3 386 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ugt2a2Q6PDD0 528 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Scn3bQ8BHK2 215 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cpsf4Q8BQZ5 211 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Man2a2Q8BRK9 1152 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Catsper4Q8BVN3 442 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Galnt13Q8CF93 556 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Plbd1Q8VCI0 550 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lars2Q8VDC0 902 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nrif1Q923B3 828 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sec14l2Q99J08 403 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tada1Q99LM9 335 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lrrc4Q99PH1 652 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Det1Q9D0A0 550 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Kctd4Q9D7X1 259 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dnajb4Q9D832 337 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Erp27Q9D8U3 272 aa6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Myh10Q61879 1976 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
Trps1-201ENSMUST00000077935 Arhgef37A1IGU4 676 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm13088A2AGW6 460 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr1123A2AT85 323 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm3173A6NAS3 172 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm3020E9Q3J7 150 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 JhyE9Q793 770 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm6465F7A7Y6 181 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm2897K7N6T7 172 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm8011K7N6Y5 207 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm8906L7N2A2 181 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Unc5cO08747 931 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 CatP24270 527 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 LhcgrP30730 700 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tff2Q03404 129 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm853Q3UNZ2 425 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lsmem1Q3UQS2 128 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.2 ms