RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000050010.10

Vamp4-201, Transcript of Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Vamp4, Length 2,532 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4-201ENSMUST00000050010 TsnQ62348 228 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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Vamp4-201ENSMUST00000050010 Zswim9Q6DI92 447 aa9.5□□□□□ -0.89
Vamp4-201ENSMUST00000050010 Sarm1Q6PDS3 724 aa9.5□□□□□ -0.89
Vamp4-201ENSMUST00000050010 Zfp606Q7TSV0 794 aa9.5□□□□□ -0.89
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Vamp4-201ENSMUST00000050010 Olfr293Q7TS10 336 aa9.49□□□□□ -0.89
Vamp4-201ENSMUST00000050010 Ubp1Q811S7 540 aa9.49□□□□□ -0.89
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Vamp4-201ENSMUST00000050010 Gm3591K7N6X2 186 aa9.48□□□□□ -0.89
Vamp4-201ENSMUST00000050010 Kpna3O35344 521 aa9.48□□□□□ -0.89
Vamp4-201ENSMUST00000050010 Syn1O88935 706 aa9.48□□□□□ -0.89
Vamp4-201ENSMUST00000050010 Atp1b2P14231 290 aa9.48□□□□□ -0.89
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Vamp4-201ENSMUST00000050010 SgcgP82348 291 aa9.48□□□□□ -0.89
Vamp4-201ENSMUST00000050010 Atp5jP97450 108 aa9.48□□□□□ -0.89
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