RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027127.13

Sf3b1-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b1, Length 6,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 HecaQ3V1N5 544 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc22a15Q504N2 544 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PhgdhQ61753 533 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cox8aQ64445 69 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lemd2Q6DVA0 511 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Prrg3Q6PAQ9 231 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Itln1bQ80ZA0 313 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Atl1Q8BH66 558 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Shc2Q8BMC3 573 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sit1Q8C503 180 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rbm34Q8C5L7 375 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr342Q8VGK7 312 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pcdhb4Q91XZ6 784 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 B3galt6Q91Z92 325 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Unc50Q9CQ61 259 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rsph14Q9D3W1 341 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cldn19Q9ET38 224 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc7a9Q9QXA6 487 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dyrk1bQ9Z188 629 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sirpb1aA0A0A6YYP6 397 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mrgpra2aA0A0R4J1Z0 331 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 AccsA2AIG8 502 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm13101A2ASJ0 481 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zcchc7B1AX39 541 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fam181aJ3QNB7 292 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cbx4O55187 551 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 A630001G21RikQ3UTB2 229 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mks1Q5SW45 561 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Eif2b4Q61749 524 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pfkfb4Q6DTY7 469 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Krt72Q6IME9 520 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rbbp8Q80YR6 893 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ppp1r15bQ8BFW3 697 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Neu4Q8BZL1 478 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zswim3Q8CFL8 695 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PclafQ9CQX4 110 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lrrc17Q9CXD9 443 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kcne2Q9D808 123 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ddi1Q9DAF3 408 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 TesclQ9DAJ7 231 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Isca2Q9DCB8 154 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc28a3Q9ERH8 703 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kat2aQ9JHD2 830 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rpl38Q9JJI8 70 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc27a6E9Q9W4 619 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ptar1E9QAB6 424 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kcnn4O89109 425 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Plk2P53351 682 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 AdprhP54923 362 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Erp29P57759 262 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm5800Q497L3 186 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cspg5Q71M36 566 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Phf24Q80TL4 400 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gpat3Q8C0N2 438 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tnfaip8Q921Z5 198 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Znrf4Q9DAH2 327 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 SgshQ9EQ08 502 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 St6galnac1Q9QZ39 526 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Atp6ap1Q9R1Q9 463 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn2r115E9Q0E7 857 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm16494E9Q2Z4 87 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Socs5O54928 536 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ldb2O55203 373 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 CcnfP51944 777 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Bpifa6Q0VGU8 367 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Larp4bQ6A0A2 741 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zfp418Q8BFS8 652 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pdcd2lQ8C5N5 364 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lin52Q8CD94 116 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn1r206Q8R277 312 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cxxc5Q91WA4 317 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fig4Q91WF7 907 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 NtpcrQ9CQA9 190 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Bcl10Q9Z0H7 233 aa8.39□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 S100zB9EJL3 99 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ctnnd2O35927 1247 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pdlim1O70400 327 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Itm2bO89051 266 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pim3P58750 326 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gabrb3P63080 473 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Six3Q62233 333 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Spon2Q8BMS2 330 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kdelr3Q8R1L4 214 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pex19Q8VCI5 299 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cnot11Q9CWN7 505 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 5530400C23RikQ9D3I0 173 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dnajb2Q9QYI5 324 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Aqp5Q9WTY4 265 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nrf1Q9WU00 503 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 F2P19221 618 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ddx6P54823 483 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mocs1Q5RKZ7 636 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Bdkrb1Q61125 334 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Scn3bQ8BHK2 215 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Wdr47Q8CGF6 920 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Wfdc1Q9ESH5 211 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pole3Q9JKP7 145 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nufip1Q9QXX8 484 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rgs20Q9QZB1 239 aa8.38□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sgk2Q9QZS5 367 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.9 ms