RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 C21orf2O43822 256 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 RP2O75695 350 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF823P16415 610 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ARL3P36405 182 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GRK6P43250 576 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 HERVK_113P62684 666 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ACTC1P68032 377 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ACTA1P68133 377 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 POU4F2Q12837 409 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 DHCR24Q15392 516 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 IFI44LQ53G44 452 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GPR107Q5VW38 600 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 UBR7Q8N806 425 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FAM47BQ8NA70 645 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 AGAP11Q8TF27 550 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PI4K2AQ9BTU6 479 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 KATNBL1Q9H079 304 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MBD5Q9P267 1494 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 C2orf74A8MZ97 194 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TNFRSF11BO00300 401 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 NDUFS2O75306 463 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CLDN9O95484 217 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CDH13P55290 713 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ERVK-9P63128 1117 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SEMA3AQ14563 771 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 RAB41Q5JT25 222 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 VSTM1Q6UX27 236 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MOB2Q70IA6 237 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 OR8D1Q8WZ84 308 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PHF21BQ96EK2 531 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MRIQ9BWK5 157 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 STK16O75716 305 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ATE1O95260 518 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SGPL1O95470 568 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CASP1P29466 404 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FMO4P31512 558 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FAAP100Q0VG06 881 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TROAPQ12815 778 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 HACD4Q5VWC8 232 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 RNF44Q7L0R7 432 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TRABD2AQ86V40 505 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 DENND1CQ8IV53 801 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TNS4Q8IZW8 715 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF563Q8TA94 476 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CDC14AQ9UNH5 594 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PTPRJQ12913 1337 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PP2D1A8MPX8 630 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MICAL2O94851 1124 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 C9P02748 559 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 BPGMP07738 259 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SPARCP09486 303 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ERLEC1Q96DZ1 483 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CDC6Q99741 560 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 POTEKPQ9BYX7 375 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CXorf21Q9HAI6 301 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 VWA7Q9Y334 891 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 AMD1P17707 334 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FSHRP23945 695 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CRISP3P54108 245 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PACS2Q86VP3 889 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 OR4L1Q8NH43 312 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MIPEPQ99797 713 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MMP27Q9H306 513 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 NUDT15Q9NV35 164 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PLLPQ9Y342 182 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ASB4Q9Y574 426 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 H0YGN5 161 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 DLGAP1O14490 977 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 HRGP04196 525 aa6.3□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 EPORP19235 508 aa6.3□□□□□ -1.4
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