RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623316.1

ATRX-210, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-210ENST00000623316 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 KAT6AQ92794 2004 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 A0A1W2PQF6 199 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 A8MZ25 164 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 KCNJ18B7U540 433 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 H3BQV1 296 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 RB1P06400 928 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 LINC00271P0C7V0 271 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 ACTN1P12814 892 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 KRT10P13645 584 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 SLC2A4P14672 509 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 RPA1P27694 616 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 PRPHP41219 470 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 RARRES1P49788 294 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 GPC3P51654 580 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 PLP2Q04941 152 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 PKP1Q13835 747 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 AWAT1Q58HT5 328 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 XKR9Q5GH70 373 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 FAM228AQ86W67 206 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 UEVLDQ8IX04 471 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 POC5Q8NA72 575 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 LRRC15Q8TF66 581 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 SEPT8Q92599 483 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 TOP1MTQ969P6 601 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 CEP170P1Q96L14 293 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 GUCD1Q96NT3 240 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 OR10A4Q9H209 315 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 CLIC4Q9Y696 253 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 WDR81Q562E7 1941 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 TANC1Q9C0D5 1861 aa6.05□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 EVPLQ92817 2033 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 EPOPA6NHQ4 379 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 ADAM20O43506 726 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 STX6O43752 255 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 GJB5O95377 273 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 HSPA4LO95757 839 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 HEXAP06865 529 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 PRR35P0CG20 571 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 ARL2P36404 184 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 AVPR1BP47901 424 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 LMAN1P49257 510 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 ARSFP54793 590 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 TAP1Q03518 808 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 TUBA3CQ13748 450 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 NTRK2Q16620 822 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 GARNL3Q5VVW2 1013 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 TXNDC8Q6A555 127 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 AMER2Q8N7J2 671 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 APBB2Q92870 758 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 TMEM143Q96AN5 459 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 PGAM5Q96HS1 289 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 FRG2BQ96QU4 278 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 USP28Q96RU2 1077 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 APOL6Q9BWW8 343 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 NUF2Q9BZD4 464 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 RABEP2Q9H5N1 569 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 POLD4Q9HCU8 107 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 GRHL1Q9NZI5 618 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 GINS2Q9Y248 185 aa6.04□□□□□ -1.44
ATRX-210ENST00000623316 TTC28Q96AY4 2481 aa6.04□□□□□ -1.44
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