RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597512.1

FCHO1-221, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FCHO1, Length 2,934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-221ENST00000597512 GPRC6AQ5T6X5 926 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 RFLNAQ6ZTI6 216 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 TWIST2Q8WVJ9 160 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 ASB16Q96NS5 453 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 DCLRE1BQ9H816 532 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 TULP3O75386 442 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 NFATC1O95644 943 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 FSHRP23945 695 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 SQLEQ14534 574 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 PPP1R3AQ16821 1122 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 SBSNQ6UWP8 590 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 CYHR1Q6ZMK1 362 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 DEFB107AQ8IZN7 70 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 VN1R2Q8NFZ6 395 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 SMARCD2Q92925 531 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 LRIG1Q96JA1 1093 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 LMAN2LQ9H0V9 348 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 PLXNA2O75051 1894 aa13.61□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 UPK3BL1B0FP48 263 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 UPK3BL2E5RIL1 263 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 S100BP04271 92 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 CTSLP07711 333 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 ARSAP15289 507 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 CD1EP15812 388 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 PBX2P40425 430 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 FOXA1P55317 472 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 ST8SIA6P61647 398 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 CRY1Q16526 586 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 TTLL9Q3SXZ7 439 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 PANX3Q96QZ0 392 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 HGH1Q9BTY7 390 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 LATS2Q9NRM7 1088 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 AIM2O14862 343 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 RAD51BO15315 384 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 CRCPO75575 148 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 NUDT2P50583 147 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 RBBP7Q16576 425 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF805Q5CZA5 627 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 FAM219BQ5XKK7 198 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 OR56A4Q8NGH8 313 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 HCAR2Q8TDS4 363 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 FGF13Q92913 245 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 STMN2Q93045 179 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 C3orf30Q96M34 536 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 KCNA7Q96RP8 456 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 MTG2Q9H4K7 406 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 EBF3Q9H4W6 596 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 PCDH12Q9NPG4 1184 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 CD84Q9UIB8 345 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 H0Y3Z8 333 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 E2F3O00716 465 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 PIP5K1BO14986 540 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 TIMP2P16035 220 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 KCNC3Q14003 757 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 C16orf89Q6UX73 402 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 KYQ8NBH2 561 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 ZFYVE19Q96K21 471 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 SPATA16Q9BXB7 569 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 CXorf56Q9H5V9 222 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 ELOVL2Q9NXB9 296 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 DKK3Q9UBP4 350 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 CDH22Q9UJ99 828 aa13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 GIPC1O14908 333 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 ATP6AP2O75787 350 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 ESRRBO95718 433 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 XPAP23025 273 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 B4GALNT1Q00973 533 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 C1orf146Q5VVC0 180 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 DDIASQ8IXT1 998 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 GDPD5Q8WTR4 605 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 ABCG8Q9H221 673 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 DZANK1Q9NVP4 752 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 KCTD5Q9NXV2 234 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 KLHL42Q9P2K6 505 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 OARD1Q9Y530 152 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 A0A1B0GTL3 188 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 FFAR2O15552 330 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 PSMG1O95456 288 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 OR56A5P0C7T3 313 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 DCDC1P59894 354 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 CDC16Q13042 620 aa13.59□□□□□ -0.23
FCHO1-221ENST00000597512 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms