RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583514.5

LLGL2-221, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, human

TSL 3

Gene LLGL2, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LLGL2-221	ENST00000583514	ITGB2	P05107	769 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	ACP5	P13686	325 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	GUCY2D	Q02846	1103 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	HHEX	Q03014	270 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	AP1B1	Q10567	949 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	FAM129C	Q86XR2	697 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	OR10G6	Q8NH81	332 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	EID2B	Q96D98	161 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		15.37	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	EFCAB7	A8K855	629 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514		A8MU76	341 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	DUX1	O43812	170 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	PIRT	P0C851	137 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	CDKN2B	P42772	138 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC7A5	Q01650	507 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	GPS2	Q13227	327 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	DUPD1	Q68J44	220 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	IYD	Q6PHW0	289 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	NPNT	Q6UXI9	565 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	NKD1	Q969G9	470 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	AGAP3	Q96P47	875 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	TRIB3	Q96RU7	358 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	FUT8	Q9BYC5	575 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	RMI1	Q9H9A7	625 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	PDP2	Q9P2J9	529 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		15.36	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	APOL1	O14791	398 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	GRID2	O43424	1007 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC28A2	O43868	658 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	NUAK1	O60285	661 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	GAS8	O95995	478 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC4A1	P02730	911 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	FAM87A	P0C7U9	286 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	UGT1A3	P35503	534 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	PTGIR	P43119	386 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	MAPK9	P45984	424 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	ATP1A2	P50993	1020 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	NFATC3	Q12968	1075 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	TFDP2	Q14188	446 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	PDK1	Q15118	436 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	PCSK7	Q16549	785 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	TBR1	Q16650	682 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	ALS2CL	Q60I27	953 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	MREG	Q8N565	214 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	GPR26	Q8NDV2	337 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	NCSTN	Q92542	709 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	DDA1	Q9BW61	102 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	OR2AG1	Q9H205	316 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	OGFR	Q9NZT2	677 aa		15.35	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514		A6NCN8	305 aa		15.34	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514		B4E171	279 aa		15.34	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	F3	P13726	295 aa		15.34	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	TSPAN7	P41732	249 aa		15.34	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	DYNLT1	P63172	113 aa		15.34	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	CAV1	Q03135	178 aa		15.34	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	CDK18	Q07002	472 aa		15.34	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		15.34	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	ANKS6	Q68DC2	871 aa		15.34	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	AADACL2	Q6P093	401 aa		15.34	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	XKR5	Q6UX68	686 aa		15.34	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		15.34	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	BBS12	Q6ZW61	710 aa		15.34	■□□□□ 0.05
LLGL2-221	ENST00000583514	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		15.34	■□□□□ 0.05

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