RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577498.1

IFT20-204, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 4

Gene IFT20, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-204ENST00000577498 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 IGLON5A6NGN9 336 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SYCE1LA8MT33 242 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 IQCF5A8MTL0 148 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SNX3O60493 162 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 KERAO60938 352 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 TRIM16O95361 564 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 FTH1P02794 183 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 TPBGLP0DKB5 382 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 CHRNB1P11230 501 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SERPINB5P36952 375 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 RPS21P63220 83 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 NFKB2Q00653 900 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 OCRLQ01968 901 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 RAET1GQ6H3X3 334 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SPATA21Q7Z572 469 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 CACUL1Q86Y37 369 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 CPNE9Q8IYJ1 553 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 CCDC197Q8NCU1 140 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ASB12Q8WXK4 309 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 LINGO1Q96FE5 620 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 MRGPRX1Q96LB2 322 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 NELL2Q99435 816 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 C5orf42Q9H799 3197 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SMIM24O75264 130 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 IPO13O94829 963 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 GSTM1P09488 218 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ACADMP11310 421 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 AOAHP28039 575 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SLC1A6P48664 564 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 DGKEP52429 567 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ADPRHP54922 357 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 STARD6P59095 220 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 GSTM4Q03013 218 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 OR4D1Q15615 310 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 TMEM259Q4ZIN3 620 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 CES4AQ5XG92 561 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 CGB2Q6NT52 195 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SZT2Q5T011 3432 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 A8MT66 165 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 BTN3A1O00481 513 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SGTAO43765 313 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 VEGFDO43915 354 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 NPHS1O60500 1241 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ATG13O75143 517 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ITGB6P18564 788 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 NDUFV2P19404 249 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 CD72P21854 359 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 PRLHRP49683 370 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 NAA20P61599 178 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 GBX1Q14549 363 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 BCL7AQ4VC05 210 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 PNCKQ6P2M8 343 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SYT13Q7L8C5 426 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 HORMAD1Q86X24 394 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 OR14C36Q8NHC7 312 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SGF29Q96ES7 293 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 COX14Q96I36 57 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 HIC2Q96JB3 615 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 TRIM55Q9BYV6 548 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 TRIM39Q9HCM9 518 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms