RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560715.5

TSPAN3-209, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 2,892 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-209ENST00000560715 HIPK4Q8NE63 616 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 COQ7Q99807 217 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 KCNN3Q9UGI6 736 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 CDH22Q9UJ99 828 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 PCDHA12Q9UN75 941 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 ALG6Q9Y672 507 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 ROBO3Q96MS0 1386 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 A0A1W2PPW3 197 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 MEI4A8MW99 385 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 B8ZZF3 427 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 SMIM22K7EJ46 135 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 SNAP91O60641 907 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 ACTN1P12814 892 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 AOC1P19801 751 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 CD72P21854 359 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 DCKP27707 260 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC25A3Q00325 362 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 RALGDSQ12967 914 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 ADGRE1Q14246 886 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 NPTX1Q15818 432 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 INSCQ1MX18 579 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 CYP4A22Q5TCH4 519 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 C12orf60Q5U649 245 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 C11orf63Q6NUN7 778 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 CHSY1Q86X52 802 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 KIAA2013Q8IYS2 634 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 ASB15Q8WXK1 588 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 PWWP2AQ96N64 755 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 PRRX2Q99811 253 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 CIB1Q99828 191 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 C1orf50Q9BV19 199 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 CDC14AQ9UNH5 594 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.68□□□□□ -1.34
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TSPAN3-209ENST00000560715 SNTNA6NMZ2 147 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 STMND1H3BQB6 276 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 LAD1O00515 517 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 NUAK1O60285 661 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 KCNJ13O60928 360 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 ATF2P15336 505 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 IL32P24001 234 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 MAGEA4P43358 317 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 MARCKSL1P49006 195 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 CASP9P55211 416 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 CDH8P55286 799 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 STX3Q13277 289 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 RUNX2Q13950 521 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 STILQ15468 1287 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 FGD3Q5JSP0 725 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.68□□□□□ -1.34
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TSPAN3-209ENST00000560715 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 OLIG1Q8TAK6 271 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.68□□□□□ -1.34
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TSPAN3-209ENST00000560715 EXT2Q93063 718 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 TP53INP1Q96A56 240 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 CMTM3Q96MX0 182 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 VPS35Q96QK1 796 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 WRNIP1Q96S55 665 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 GPR20Q99678 358 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 CLPBQ9H078 707 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 WWP1Q9H0M0 922 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 RMND5AQ9H871 391 aa6.68□□□□□ -1.34
TSPAN3-209ENST00000560715 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.68□□□□□ -1.34
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