RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 DOCK3Q8IZD9 2030 aa5.51□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TRPM7Q96QT4 1865 aa5.51□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 A0A088AWK7 358 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 A0A1W2PPM1 405 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TMEM120BA0PK00 339 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 ZAR1LA6NP61 321 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 KBTBD13C9JR72 458 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 DNM1LO00429 736 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SYN3O14994 580 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 IRAK2O43187 625 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PIAS1O75925 651 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 VNN2O95498 520 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 FAM107AO95990 144 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CXCL10P02778 98 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 GALTP07902 379 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 BRAFP15056 766 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 FDFT1P37268 417 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TSPY1Q01534 308 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 BFSP2Q13515 415 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PDK1Q15118 436 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TMED2Q15363 201 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PARP6Q2NL67 630 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SLC39A12Q504Y0 691 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SYCP2LQ5T4T6 812 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 MANEALQ5VSG8 457 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 C6orf89Q6UWU4 347 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 C4orf50Q6ZRC1 276 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CCDC149Q6ZUS6 474 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SH2D5Q6ZV89 423 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TAOK1Q7L7X3 1001 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PIGWQ7Z7B1 504 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SCN4BQ8IWT1 228 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 LRRC34Q8IZ02 419 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PDIK1LQ8N165 341 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 ZNF567Q8N184 647 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 MPP5Q8N3R9 675 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 NPWQ8N729 165 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 ATP11CQ8NB49 1132 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 FAM156AQ8NDB6 213 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 IL17RDQ8NFM7 739 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 OR10H5Q8NGA6 315 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 URGCPQ8TCY9 931 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 DCAKDQ8WVC6 231 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CASP10Q92851 521 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CHMP6Q96FZ7 201 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SPATA13Q96N96 652 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 KCNK9Q9NPC2 374 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SMYD2Q9NRG4 433 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 ABCC13Q9NSE7 274 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 DDIT4Q9NX09 232 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 OSER1Q9NX31 292 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SAGE1Q9NXZ1 904 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PTGFRNQ9P2B2 879 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 FETUBQ9UGM5 382 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 NEU3Q9UQ49 428 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CHMP2BQ9UQN3 213 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TTLL3Q9Y4R7 772 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SCN1AP35498 2009 aa5.5□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 FAM92AA1XBS5 289 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 OR6C75A6NL08 312 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 DRGXA6NNA5 263 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 KCNU1A8MYU2 1149 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 FAM227AF5H4B4 570 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 LEFTY2O00292 366 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 NDUFAB1O14561 156 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TPP1O14773 563 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TYROBPO43914 113 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SPAG7O75391 227 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 FAM155BO75949 473 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 GSTA2P09210 222 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 MLNP12872 115 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SLC6A2P23975 617 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PRKCHP24723 683 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 LMO1P25800 156 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PTPN3P26045 913 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 ATP5DP30049 168 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 HOXC13P31276 330 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms