RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	CITED4	Q96RK1	184 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	NRTN	Q99748	197 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	FICD	Q9BVA6	458 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TLR10	Q9BXR5	811 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	WDR26	Q9H7D7	661 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GULP1	Q9UBP9	304 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	KL	Q9UEF7	1012 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	AMACR	Q9UHK6	382 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	AMFR	Q9UKV5	643 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GPR34	Q9UPC5	381 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF711	Q9Y462	761 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CACNA1B	Q00975	2339 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC66	A2RUB6	948 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	USP27X	A6NNY8	438 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048		B4DGG1	531 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PSMD11	O00231	422 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TPP1	O14773	563 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TNFRSF10C	O14798	259 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PPM1D	O15297	605 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	YKT6	O15498	198 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	KCNN4	O15554	427 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SGTA	O43765	313 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TRIM16	O95361	564 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	NDST3	O95803	873 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	MT-CO3	P00414	261 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TNF	P01375	233 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	RBP3	P10745	1247 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TPH1	P17752	444 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	RAB6A	P20340	208 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CXCR5	P32302	372 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ADM	P35318	185 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ADCY8	P40145	1251 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GPR1	P46091	355 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CTSC	P53634	463 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	EPHB1	P54762	984 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	KIF5A	Q12840	1032 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	XRCC4	Q13426	336 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ARHGEF7	Q14155	803 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PTK2B	Q14289	1009 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	NR0B2	Q15466	257 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SLC1A5	Q15758	541 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CHRNA6	Q15825	494 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PYCR3	Q53H96	274 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	KCTD11	Q693B1	232 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	RANBP10	Q6VN20	620 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	DTX1	Q86Y01	620 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	NAGS	Q8N159	534 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	BBS5	Q8N3I7	341 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PAF1	Q8N7H5	531 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61

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