RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 GBE1Q04446 702 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 OR6Y1Q8NGX8 325 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ART4Q93070 314 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 GPR174Q9BXC1 333 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 MCOLN1Q9GZU1 580 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TOR4AQ9NXH8 423 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 KCNK4Q9NYG8 393 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 DNAJB4Q9UDY4 337 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 HEPACAM2A8MVW5 462 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TRAPPC6AO75865 159 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 PDE5AO76074 875 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ASMTP46597 345 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 PNLIPRP1P54315 467 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ACTR3P61158 418 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TSTD2Q5T7W7 516 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TTC23Q5W5X9 447 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 RTL4Q6ZR62 310 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 KIAA2013Q8IYS2 634 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ACMSDQ8TDX5 336 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 BAP1Q92560 729 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 EBPLQ9BY08 206 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 RHOJQ9H4E5 214 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 HMGXB4Q9UGU5 601 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 GPR34Q9UPC5 381 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 AP4S1Q9Y587 144 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 EFCAB10A6NFE3 127 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 IL6P05231 212 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 CA3P07451 260 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 KCNQ1P51787 676 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 LPAL2Q16609 132 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 PLEKHG6Q3KR16 790 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SULT1C3Q6IMI6 304 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 OAFQ86UD1 273 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 PLD5Q8N7P1 536 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 C8orf48Q96LL4 319 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 CRTAC1Q9NQ79 661 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SERTAD3Q9UJW9 196 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ILVBLA1L0T0 632 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 H0YC42 278 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SUV39H1O43463 412 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 VNN1O95497 513 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 HEXBP07686 556 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 S100GP29377 79 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 GABRB2P47870 512 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 PLA2G16P53816 162 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 EPS8Q12929 822 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 GPR17Q13304 367 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TAF5Q15542 800 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SLC8B1Q6J4K2 584 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF730Q6ZMV8 503 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SPATA19Q7Z5L4 167 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 CUZD1Q86UP6 607 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC103Q8IW40 242 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ULK2Q8IYT8 1036 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TERB1Q8NA31 727 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 KCT2Q8NC54 265 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 XAGE5Q8WWM1 108 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 OVCA2Q8WZ82 227 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC46Q96FV0 321 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 BTBD10Q9BSF8 475 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 C9orf16Q9BUW7 83 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 IPPKQ9H8X2 491 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 ARHGEF3Q9NR81 526 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 MYADML2A6NDP7 307 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM24O15164 1050 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 SLC22A3O75751 556 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 BMPR1AP36894 532 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 CHIT1Q13231 466 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 OASLQ15646 514 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 LY6G5CQ5SRR4 150 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 GCNT6Q5T4J0 391 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 GALNT18Q6P9A2 607 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 STK32AQ8WU08 396 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM125Q96AQ2 219 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 PWWP2AQ96N64 755 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 MINDY3Q9H8M7 445 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRB-204ENST00000538708 FTSJ1Q9UET6 329 aa9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms