RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJC6O75061 913 aa22.41■■□□□ 1.18
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TSNARE1-208ENST00000524325 TAS2R39P59534 338 aa22.41■■□□□ 1.18
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TSNARE1-208ENST00000524325 C11orf74Q86VG3 221 aa22.41■■□□□ 1.18
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TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.39■■□□□ 1.18
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TSNARE1-208ENST00000524325 HEXDCQ8WVB3 486 aa22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 ACP5P13686 325 aa22.38■■□□□ 1.17
TSNARE1-208ENST00000524325 PRLHRP49683 370 aa22.38■■□□□ 1.17
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