RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LTB4R2Q9NPC1 389 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHST11Q9NPF2 352 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PANK4Q9NVE7 773 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FEM1BQ9UK73 627 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POMT2Q9UKY4 750 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERVK-11Q9UQG0 969 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa0.72□□□□□ -2.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNAP23O00161 211 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNM1LO00429 736 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNN4O15554 427 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEC14L5O43304 696 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IDH3BO43837 385 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CNPP09543 421 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GP9P14770 177 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF19P17023 458 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POU1F1P28069 291 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACTR2P61160 394 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP2R5BQ15173 497 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DUOXA1Q1HG43 343 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PGBD2Q6P3X8 592 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGFL3Q6UXB1 125 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KSR2Q6VAB6 950 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PACS1Q6VY07 963 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C11orf96Q7Z7L8 435 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MARCH9Q86YJ5 346 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC13Q8IYE1 715 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRYBG2Q8N1P7 616 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C11orf42Q8N5U0 333 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KBTBD8Q8NFY9 601 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR4C3Q8NH37 302 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AFG1LQ8WV93 481 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HPSE2Q8WWQ2 592 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STAMQ92783 540 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGSF8Q969P0 613 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SDCCAG3Q96C92 435 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLEC7AQ9BXN2 247 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAOK3Q9H2K8 898 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COQ3Q9NZJ6 369 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 THEGQ9P2T0 379 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCINQ9Y6U3 715 aa0.71□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACOD1A6NK06 481 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR6C76A6NM76 312 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 M0QZ24 198 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF195O14628 629 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANP32CO43423 234 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRCH4O75427 683 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SELLP14151 372 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYP2A7P20853 494 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NR2F2P24468 414 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GNALP38405 381 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MMP12P39900 470 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HALP42357 657 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 B3GALT5-AS1P59052 145 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNJ10P78508 379 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ICA1Q05084 483 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR17Q13304 367 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FGFBP1Q14512 234 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POSTNQ15063 836 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 E2F5Q15329 346 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYLK3Q32MK0 819 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SIGIRRQ6IA17 410 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MOGAT3Q86VF5 341 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNMB4Q86W47 210 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF354CQ86Y25 554 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTOV1Q86YD1 416 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LACC1Q8IV20 430 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM57Q8N5G2 664 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AQP11Q8NBQ7 271 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C11orf45Q8TAV5 145 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AZIN2Q96A70 460 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM143Q96AN5 459 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SH3KBP1Q96B97 665 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF285Q96NJ3 590 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VEZTQ9HBM0 779 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SAYSD1Q9NPB0 183 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RASSF1Q9NS23 344 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 B4GALT7Q9UBV7 327 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRCT1Q9UGL9 99 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MUTYHQ9UIF7 546 aa0.7□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms