RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM45AQ9NWC5 275 aa7.17□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 IRAK4Q9NWZ3 460 aa7.17□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 FBXW11Q9UKB1 542 aa7.17□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF510Q9Y2H8 683 aa7.17□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 RNF11Q9Y3C5 154 aa7.17□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 AP4S1Q9Y587 144 aa7.17□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.17□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.17□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.17□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.17□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 NOTCH4Q99466 2003 aa7.17□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 HEATR9A2RTY3 570 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 TSPAN1O60635 241 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 CBFA2T3O75081 653 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 XYLBO75191 536 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 GPR32O75388 356 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 POMCP01189 267 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 LTFP02788 710 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 SLC35E2BP0CK96 405 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 HLA-EP13747 358 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 MYF6P23409 242 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 HTR7P34969 479 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 DPP6P42658 865 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 OSTNP61366 133 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 COG7P83436 770 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 FOXM1Q08050 763 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 CDH17Q12864 832 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 PRPSAP1Q14558 356 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 SLC14A2Q15849 920 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 XKR4Q5GH76 650 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 PCID2Q5JVF3 399 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ALKAL1Q6UXT8 129 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 PID1Q7Z2X4 250 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF554Q86TJ5 538 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ACOT1Q86TX2 421 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 PGBD3Q8N328 593 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 FRMD1Q8N878 549 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 C12orf29Q8N999 325 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 HIPK4Q8NE63 616 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 BEST2Q8NFU1 509 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 OR52K1Q8NGK4 314 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 TSPEARQ8WU66 669 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 TFAP2CQ92754 450 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 EME1Q96AY2 570 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 RSPRY1Q96DX4 576 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 SLC45A3Q96JT2 553 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ZFYVE19Q96K21 471 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 TNIP3Q96KP6 325 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 CNBD2Q96M20 576 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 CCT7Q99832 543 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 SLC25A23Q9BV35 468 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 TRIM15Q9C019 465 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 MEAF6Q9HAF1 191 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 SPAG4Q9NPE6 437 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 OLAHQ9NV23 265 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 FAIMQ9NVQ4 179 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF358Q9NW07 568 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 SNTG2Q9NY99 539 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 GTSE1Q9NYZ3 720 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 GDE1Q9NZC3 331 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM9Q9P0T7 183 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 SLC17A6Q9P2U8 582 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ACOT9Q9Y305 439 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 SNX9Q9Y5X1 595 aa7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa7.15□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 MYBPHLA2RUH7 354 aa7.15□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 C7orf72A4D263 438 aa7.15□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 H3BSA7 217 aa7.15□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 PIRO00625 290 aa7.15□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 ADAM12O43184 909 aa7.15□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms