RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CEP112	Q8N8E3	955 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	BEST2	Q8NFU1	509 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	UTY	O14607	1347 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	FAM170A	A1A519	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331		F8VZ95	297 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ACOT8	O14734	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	HSPA12A	O43301	675 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	FER	P16591	822 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ITGB8	P26012	769 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CCKBR	P32239	447 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	RANBP1	P43487	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	PEX5	P50542	639 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ART1	P52961	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	SNX16	P57768	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	BNC1	Q01954	994 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TRAF3	Q13114	568 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	KEAP1	Q14145	624 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	GSDMA	Q96QA5	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	KIF1B	O60333	1816 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TCHH	Q07283	1943 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331		A0A1W2PPH5	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ERICH2	A1L162	156 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	C19orf81	C9J6K1	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	MAP2K7	O14733	419 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CPLX1	O14810	134 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	SEC14L5	O43304	696 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ZIC3	O60481	467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	GAGE7	O76087	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	UBL4A	P11441	157 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF12	P17014	697 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	IL4R	P24394	825 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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