RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492170.1

MRPL55-231, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L55, human

TSL 5

Gene MRPL55, Length 241 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL55-231	ENST00000492170	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		15.08	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		15.08	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		15.08	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		15.08	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	AURKA	O14965	403 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	MTSS1	O43312	755 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	BRAF	P15056	766 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	TCN2	P20062	427 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	HMGCL	P35914	325 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	HAL	P42357	657 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	SEPHS1	P49903	392 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	WNT3A	P56704	352 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	IL11RA	Q14626	422 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	OR6C1	Q96RD1	312 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	INTU	Q9ULD6	942 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		15.07	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	PSTPIP1	O43586	416 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	CST8	O60676	142 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	KCNJ13	O60928	360 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	NFKB1	P19838	968 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	COMT	P21964	271 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	SPAM1	P38567	509 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	CDKN2B	P42772	138 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	SH3BP2	P78314	561 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	SEPT6	Q14141	434 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	GPR18	Q14330	331 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	TCEAL1	Q15170	157 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	KAZN	Q674X7	775 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	IRGC	Q6NXR0	463 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	C16orf46	Q6P387	395 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	RSC1A1	Q92681	617 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	COL26A1	Q96A83	441 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	HACD3	Q9P035	362 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		15.06	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		15.05	■□□□□ 0
MRPL55-231	ENST00000492170	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	NDUFA10	O95299	355 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	EPO	P01588	193 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	ZNF28	P17035	718 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	DLST	P36957	453 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	WASHC5	Q12768	1159 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	NOMO1	Q15155	1222 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	PPP2R5E	Q16537	467 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	TAZ	Q16635	292 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	KDELC1	Q6UW63	502 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	AMZ2	Q86W34	360 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	P3H4	Q92791	437 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	VAT1	Q99536	393 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	EPN3	Q9H201	632 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	IL26	Q9NPH9	171 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	CROT	Q9UKG9	612 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	KCTD3	Q9Y597	815 aa		15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	KIAA0754	O94854	1291 aa		15.04	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	HLA-DPA1	P20036	260 aa		15.04	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	CASR	P41180	1078 aa		15.04	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	DMPK	Q09013	629 aa		15.04	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	ITGA9	Q13797	1035 aa		15.04	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	LLGL1	Q15334	1064 aa		15.04	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		15.04	■□□□□ -0
MRPL55-231	ENST00000492170	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		15.04	■□□□□ -0

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