RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489495.5

FUBP1-211, Transcript of far upstream element binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene FUBP1, Length 2,156 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1-211ENST00000489495 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 LTKP29376 864 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 AXLP30530 894 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 FMO4P31512 558 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 TRIM23P36406 574 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 POLD2P49005 469 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 ACOT2P49753 483 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 SLC12A2P55011 1212 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 GPR85P60893 370 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 HTRA3P83110 453 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 CNTN2Q02246 1040 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 TAP1Q03518 808 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 EPS8Q12929 822 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 TRAF3Q13114 568 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 PRKAA1Q13131 559 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 TNK1Q13470 666 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 MTM1Q13496 603 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 GPR50Q13585 617 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 MFSD13AQ14CX5 517 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 PDK2Q15119 407 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 PPP1R3AQ16821 1122 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 GEN1Q17RS7 908 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 PARP15Q460N3 678 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 GPAT3Q53EU6 434 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 COLEC12Q5KU26 742 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 FAM182AQ5T1J6 154 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 C12orf60Q5U649 245 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 PIK3R6Q5UE93 754 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 FAM45BPQ6NSW5 357 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 FIGNL1Q6PIW4 674 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 UTS2BQ765I0 119 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 STRADAQ7RTN6 431 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 CDH24Q86UP0 819 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 P2RY8Q86VZ1 359 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 KIF18BQ86Y91 864 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 NXPE1Q8N323 547 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 KIAA1958Q8N8K9 716 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 FNDC5Q8NAU1 212 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 OR7D4Q8NG98 312 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 OR10T2Q8NGX3 314 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 FAM45AQ8TCE6 357 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 SLC22A17Q8WUG5 538 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 DEDD2Q8WXF8 326 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 RORBQ92753 470 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 HDAC10Q969S8 669 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 PPP1R14AQ96A00 147 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 COA7Q96BR5 231 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 BIRC7Q96CA5 298 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 FAF2Q96CS3 445 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 YIPF6Q96EC8 236 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 SGCZQ96LD1 299 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 HSFY1Q96LI6 401 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 MYRFLQ96LU7 910 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 RDH12Q96NR8 316 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 TAAR9Q96RI9 348 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 BTBD2Q9BX70 525 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 PBX4Q9BYU1 374 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 DNAI2Q9GZS0 605 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 NUAK2Q9H093 628 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 VPS33BQ9H267 617 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 IKZF4Q9H2S9 585 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 PPA2Q9H2U2 334 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 OR51B5Q9H339 312 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 NIPAL2Q9H841 368 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 NTN4Q9HB63 628 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 ZFP14Q9HCL3 533 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 FANCFQ9NPI8 374 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 SNX15Q9NRS6 342 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 FAM105AQ9NUU6 356 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 FBXL12Q9NXK8 326 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 PAK5Q9P286 719 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 PGAP2Q9UHJ9 254 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF639Q9UID6 485 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 GPR52Q9Y2T5 361 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 COQ4Q9Y3A0 265 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 AUP1Q9Y679 476 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 MAST2Q6P0Q8 1798 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 ADGRA2Q96PE1 1338 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 UBR2Q8IWV8 1755 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 A0A1W2PRG6 482 aa3.63□□□□□ -1.83
FUBP1-211ENST00000489495 CCDC78A2IDD5 438 aa3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms