RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486549.5

USP4-212, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 5

Gene USP4, Length 749 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-212ENST00000486549 IL22Q9GZX6 179 aa14.53□□□□□ -0.08
USP4-212ENST00000486549 CHRAC1Q9NRG0 131 aa14.53□□□□□ -0.08
USP4-212ENST00000486549 ASIC3Q9UHC3 531 aa14.53□□□□□ -0.08
USP4-212ENST00000486549 AGAP14A8MT82 685 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 AVILO75366 819 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 POP7O75817 140 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 GOT2P00505 430 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 F3P13726 295 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 ALDH4A1P30038 563 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 FOXN2P32314 431 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 MAGEA6P43360 314 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 NPY2RP49146 381 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 PRAMEP78395 509 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 B4GALNT1Q00973 533 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 SPIDRQ14159 915 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 SPRED1Q7Z699 444 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 AMZ2Q86W34 360 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 CCNJLQ8IV13 435 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 PIANPQ8IYJ0 282 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 OR6P1Q8NGX9 317 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 NXPE2Q96DL1 559 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 DEPDC7Q96QD5 511 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 PCYOX1Q9UHG3 505 aa14.52□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 A6NCN8 305 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 PPM1DO15297 605 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 CSO75390 466 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 SLC2A4P14672 509 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 IDSP22304 550 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 PSMA3P25788 255 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 NMBRP28336 390 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 PTGIRP43119 386 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 CLCNKAP51800 687 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 OR1D5P58170 312 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 DR1Q01658 176 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 PTK6Q13882 451 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 NFE2L1Q14494 772 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 DBN1Q16643 649 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 AMZ1Q400G9 498 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 CASC4Q6P4E1 433 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 IYDQ6PHW0 289 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 CES3Q6UWW8 571 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 SFRP1Q8N474 314 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 HEXDCQ8WVB3 486 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 ZMYND15Q9H091 742 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 LRRN3Q9H3W5 708 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 RIMKLBQ9ULI2 386 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 FRYQ5TBA9 3013 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa14.51□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 KNTC1P50748 2209 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 A0A1W2PQM1 296 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 TRABD2BA6NFA1 517 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 CCDC188H7C350 402 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 CAPNS1P04632 268 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 PNLIPP16233 465 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 HHEXQ03014 270 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 ACVR1Q04771 509 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 BCL7AQ4VC05 210 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 ZNF438Q7Z4V0 828 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 TRIM48Q8IWZ4 208 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 MPP5Q8N3R9 675 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 OR4L1Q8NH43 312 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 WDR48Q8TAF3 677 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 SLCO2A1Q92959 643 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 SERPINB12Q96P63 405 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 KRT12Q99456 494 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 SLC38A3Q99624 504 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 TRIM51Q9BSJ1 452 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 NRSN2Q9GZP1 204 aa14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP4-212ENST00000486549 KCNK4Q9NYG8 393 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms