RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261	TNF	P01375	233 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	PROS1	P07225	676 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	KIT	P10721	976 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	PON1	P27169	355 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	IL12RB1	P42701	662 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	GPD2	P43304	727 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	IRX4	P78413	519 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	TYRO3	Q06418	890 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	COX20	Q5RI15	118 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261		Q6ZNB5	142 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	SGK3	Q96BR1	496 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	FAM221A	A4D161	298 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	TLR4	O00206	839 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	ARNTL	O00327	626 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC31A1	O15431	190 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	TTI1	O43156	1089 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	PCDHGA12	O60330	932 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	TMCC1	O94876	653 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	OR5F1	O95221	314 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	RALB	P11234	206 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	GFAP	P14136	432 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	ITPKA	P23677	461 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	ARFIP1	P53367	373 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	NR1H2	P55055	460 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	KLC1	Q07866	573 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	PTK6	Q13882	451 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	STK40	Q8N2I9	435 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC43A2	Q8N370	569 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	DEFB119	Q8N690	84 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM159	Q96B96	161 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261		A0A1W2PP55	124 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261		A0A1W2PPC4	97 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261		A0A1W2PQC6	194 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261		K7EQS6	105 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	PIK3R2	O00459	728 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	SULT1B1	O43704	296 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	SPOP	O43791	374 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	APOL3	O95236	402 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	CLEC3B	P05452	202 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	CHM	P24386	653 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	ADRA1B	P35368	520 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	HOXD13	P35453	343 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	HTR2B	P41595	481 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	ERF	P50548	548 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	NDST2	P52849	883 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	PPP5C	P53041	499 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	CALCOCO2	Q13137	446 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	SPIDR	Q14159	915 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	FLOT2	Q14254	428 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	KRT33B	Q14525	404 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	NR0B2	Q15466	257 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KRIT1-222	ENST00000486261	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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