RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484109.1

ABCC4-205, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 4, human

TSL 2

Gene ABCC4, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC4-205	ENST00000484109	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109		H0YIN7	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	SCAMP1	O15126	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ZNF217	O75362	1048 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	CD4	P01730	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	NR3C1	P04150	777 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	LIPF	P07098	398 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	MSH3	P20585	1137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	MSH2	P43246	934 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	KRT32	Q14532	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	LITAF	Q99732	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	YIPF1	Q9Y548	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	DUXA	A6NLW8	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109		J3QR06	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	OGG1	O15527	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	SERPINB2	P05120	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	CHM	P24386	653 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ACADL	P28330	430 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	CHRNB4	P30926	498 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TMEM198	Q66K66	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	KLHL35	Q6PF15	583 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	GAD1	Q99259	594 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	GFI1	Q99684	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	SH2D4A	Q9H788	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	MBD4	O95243	580 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	MAN1A1	P33908	653 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ARL3	P36405	182 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	GPR143	P51810	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	PRAME	P78395	509 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	MEP1A	Q16819	746 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	RAB6C	Q53S08	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	CEP97	Q8IW35	865 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	OR2A14	Q96R47	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	HS6ST1	O60243	411 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	TMCC2	O75069	709 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	LDLR	P01130	860 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ACTN1	P12814	892 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	LAMP2	P13473	410 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	NR2C2	P49116	596 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	HSD17B4	P51659	736 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCC4-205	ENST00000484109	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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