RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480058.5

PRPF4B-205, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF4B, Length 6,775 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-205ENST00000480058 MTHFRP42898 656 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CXCR3P49682 368 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 AKR1D1P51857 326 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 DNAJB13P59910 316 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 HSF2Q03933 536 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 KLHL35Q6PF15 583 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 RTL4Q6ZR62 310 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 MIPEPQ99797 713 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ACTR6Q9GZN1 396 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 GLS2Q9UI32 602 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 TNS2Q63HR2 1409 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CXCR6O00574 342 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 PI15O43692 258 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 INMTO95050 263 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CYP11A1P05108 521 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CD40LGP29965 261 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 PSEN2P49810 448 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 MTAPQ13126 283 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CRY2Q49AN0 593 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 RABL3Q5HYI8 236 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ZNF614Q8N883 585 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 RAD51AP1Q96B01 352 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 FZD8Q9H461 694 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 IPPKQ9H8X2 491 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 KLK14Q9P0G3 267 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 SEC14L3Q9UDX4 400 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 PITPNM1O00562 1244 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 DLGAP1O14490 977 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 PRKYO43930 277 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 KLRK1P26718 216 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 THPOP40225 353 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 RORCP51449 518 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 SPIBQ01892 262 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 PDSS2Q86YH6 399 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 RAET1EQ8TD07 263 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ACDQ96AP0 544 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 LINGO1Q96FE5 620 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 USP29Q9HBJ7 922 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 RNF181Q9P0P0 153 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 COPZ2Q9P299 210 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CKLFQ9UBR5 152 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 E9PCH4 1651 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 A0A1W2PQ72 361 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ZMPSTE24O75844 475 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CCNB2O95067 398 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 PRAMEF1O95521 474 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 NFICP08651 508 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CYP2B6P20813 491 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 GABARAPL2P60520 117 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 VBP1P61758 197 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 FKBP1BP68106 108 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ABATP80404 500 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 KCNC4Q03721 635 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 OR2T5Q6IEZ7 315 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 AADACL2Q6P093 401 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 PLCZ1Q86YW0 608 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 CARNMT1Q8N4J0 409 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 OR2T29Q8NH02 315 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 STON2Q8WXE9 905 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 FKBP10Q96AY3 582 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 C12orf42Q96LP6 360 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 HAPLN3Q96S86 360 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 NPAS2Q99743 824 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 OMDQ99983 421 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 ACBD6Q9BR61 282 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF4B-205ENST00000480058 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.09□□□□□ -1.44
PRPF4B-205ENST00000480058 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.09□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms