RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1B0GTL3 188 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 MROH6A6NGR9 719 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CCL22O00626 93 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TBC1D4O60343 1298 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ODC1P11926 461 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ITIH1P19827 911 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 NR4A1P22736 598 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 HTR7P34969 479 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CTF1Q16619 201 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 METTL23Q86XA0 190 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 HID1Q8IV36 788 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 FEM1AQ9BSK4 669 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SUN2Q9UH99 717 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.79□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 OR51F1A6NGY5 319 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 HOXC8P31273 242 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ECT2LQ008S8 904 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 DPY19L1Q2PZI1 675 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 MANEALQ5VSG8 457 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF555Q8NEP9 628 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ITFG1Q8TB96 612 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 BRCA2P51587 3418 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 FAM234BA2RU67 622 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 MGEA5O60502 916 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 XYLBO75191 536 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 MTHFRP42898 656 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SUOXP51687 545 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 CHRNB3Q05901 458 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 MEP1AQ16819 746 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 AFMIDQ63HM1 303 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 DTWD1Q8N5C7 304 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PIK3C3Q8NEB9 887 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 MBOAT4Q96T53 435 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 OSER1Q9NX31 292 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PADI3Q9ULW8 664 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 Q9Y3F1 56 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TIMM22Q9Y584 194 aa14.78□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 G3V2T6 193 aa14.77□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PAGE1O75459 146 aa14.77□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV3-25P01717 112 aa14.77□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ITGB1P05556 798 aa14.77□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 ANXA6P08133 673 aa14.77□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SLC2A3P11169 496 aa14.77□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 TGM1P22735 817 aa14.77□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 XKR7Q5GH72 579 aa14.77□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.77□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.77□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 OR10T2Q8NGX3 314 aa14.77□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.77□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.77□□□□□ -0.04
TOP3B-206ENST00000436282 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 SNX2O60749 519 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 PCNAP12004 261 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF24P17028 368 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 GJA8P48165 433 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 PIGFQ07326 219 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC49Q8IUZ0 686 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 FBXO39Q8N4B4 442 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 DPP10Q8N608 796 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 PJA1Q8NG27 643 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ZFP90Q8TF47 636 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 STARD8Q92502 1023 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 HPS1Q92902 700 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF599Q96NL3 588 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM45AQ9NWC5 275 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 COMMD8Q9NX08 183 aa14.77□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 SUPT3HB4E1H0 165 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 GPR182O15218 404 aa14.76□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 KERAO60938 352 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms