RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 GPC4O75487 556 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 CISD3P0C7P0 127 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 ERVK-21P61565 698 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 RBBP7Q16576 425 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 KANK2Q63ZY3 851 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 CHSY3Q70JA7 882 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 HMGCLL1Q8TB92 370 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 STMN2Q93045 179 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 HGH1Q9BTY7 390 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 TUBB1Q9H4B7 451 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 DCLRE1BQ9H816 532 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 STX16O14662 325 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 TULP3O75386 442 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 GUCA1CO95843 209 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 FGF4P08620 206 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 SPINT3P49223 89 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 SESN3P58005 492 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 B4GALNT1Q00973 533 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGEF7Q14155 803 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 ZBTB2Q8N680 514 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 SCAMP4Q969E2 229 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 AKTIPQ9H8T0 292 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 AGAP14A8MT82 685 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 SLC22A2O15244 555 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 CRCPO75575 148 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 MACC1Q6ZN28 852 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.264e-7■■□□□ 11.5
FAAP20-209ENST00000428120 DET1Q7L5Y6 550 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 SYVN1Q86TM6 617 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 COPS8Q99627 209 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF225Q9UK10 706 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 FBXO10Q9UK96 956 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 PSMG1O95456 288 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 LINC00032P0C843 101 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 GPRC6AQ5T6X5 926 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 BRAT1Q6PJG6 821 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 HPS6Q86YV9 775 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 NXPE3Q969Y0 559 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 CDK15Q96Q40 435 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC167Q9P0B6 97 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 E2F3O00716 465 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ADH1CP00326 375 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 NSG1P42857 185 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 SLC6A11P48066 632 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 C6orf163Q5TEZ5 329 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 DSELQ8IZU8 1212 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 MYO1HQ8N1T3 1032 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 KYQ8NBH2 561 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 OR9I1Q8NGQ6 314 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 FGF13Q92913 245 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 NPAS2Q99743 824 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA16Q9BXB7 569 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 IL36AQ9UHA7 158 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 MTX2O75431 263 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 RGS4P49798 205 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ACTR3P61158 418 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC6Q16204 474 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 KIRREL3Q8IZU9 778 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 IGFLR1Q9H665 355 aa22.88■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 PHKG1Q16816 387 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 Q6ZVL8 140 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 PLPP6Q8IY26 295 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 OR52B6Q8NGF0 335 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 NUDT4Q9NZJ9 180 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 FFAR2O15552 330 aa22.87■■□□□ 1.25
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