RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF567Q8N184 647 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.897e-12■■■■■ 80.9
LIMS1-208ENST00000428064 CTRCQ99895 268 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 RAB33BQ9H082 229 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 CLMPQ9H6B4 373 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 BPIFA1Q9NP55 256 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 SMOXQ9NWM0 555 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL3Q9UH77 587 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 SUV39H1O43463 412 aa20.62■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 WISP1O95388 367 aa20.62■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEA1P43355 309 aa20.62■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 PPP2R5EQ16537 467 aa20.62■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.62■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 KAZNQ674X7 775 aa20.62■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 SARM1Q6SZW1 724 aa20.62■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS42Q7Z5A4 293 aa20.62■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.62■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 DDHD1Q8NEL9 900 aa20.62■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 EPHA6Q9UF33 1036 aa20.62■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.62■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 TERTO14746 1132 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 AMD1P17707 334 aa20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 RPL10P27635 214 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 STAT5AP42229 794 aa20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 POLE2P56282 527 aa20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 XRCC4Q13426 336 aa20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 ITGA9Q13797 1035 aa20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 IL11RAQ14626 422 aa20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 NOMO1Q15155 1222 aa20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 ATG14Q6ZNE5 492 aa20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 PID1Q7Z2X4 250 aa20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 ESX1Q8N693 406 aa20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 TC2NQ8N9U0 490 aa20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 TTC25Q96NG3 672 aa20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 MYO18BQ8IUG5 2567 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 OR52A4PA6NMU1 304 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 APOC2P02655 101 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 TYRP1P17643 537 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 HALP42357 657 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 CHRNA4P43681 627 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 CSRP3P50461 194 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 MC1RQ01726 317 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 KCNC4Q03721 635 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 GPR18Q14330 331 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 BBS12Q6ZW61 710 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 RNF214Q8ND24 703 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 GDAP1Q8TB36 358 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 RSC1A1Q92681 617 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 CXorf40BQ96DE9 158 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 TGM7Q96PF1 710 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 SEMA5BQ9P283 1151 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 PKP3Q9Y446 797 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 CCR10P46092 362 aa20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 MARCKSL1P49006 195 aa20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 COPS2P61201 443 aa20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 CDC20Q12834 499 aa20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 KCNAB2Q13303 367 aa20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 AMZ2Q86W34 360 aa20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 IPMKQ8NFU5 416 aa20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL6Q8WZ60 621 aa20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 ZDHHC12Q96GR4 267 aa20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 FSD1LQ9BXM9 530 aa20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 GBA3Q9H227 469 aa20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL33A6NCF5 533 aa20.58■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 FOXM1Q08050 763 aa20.58■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 LLGL1Q15334 1064 aa20.58■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 CHRNA6Q15825 494 aa20.58■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 FAM151BQ6UXP7 276 aa20.58■□□□□ 0.89
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