RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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HDLBP-211ENST00000425989 ZP2Q05996 745 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 PRKAA1Q13131 559 aa9.47□□□□□ -0.89
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