RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399808.4

IFITM3-201, Transcript of interferon induced transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene IFITM3, Length 808 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3-201ENST00000399808 ANKUB1A6NFN9 424 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 KMOO15229 486 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 CAPN1P07384 714 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ACY1Q03154 408 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 AGAP9Q5VTM2 703 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 CDKAL1Q5VV42 579 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 IQCKQ8N0W5 287 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 D2HGDHQ8N465 521 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ZBTB2Q8N680 514 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 GPR26Q8NDV2 337 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 MAML1Q92585 1016 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 GPR83Q9NYM4 423 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 TRIM10Q9UDY6 481 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 MED13LQ71F56 2210 aa14.72□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 RGSL1A5PLK6 1076 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ANKRD66B4E2M5 251 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 MTX2O75431 263 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 SCRG1O75711 98 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 MTA2O94776 668 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 GPR89BP0CG08 455 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 RARAP10276 462 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ATP1A3P13637 1013 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 RPL26P61254 145 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 PDE1BQ01064 536 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 RAPSNQ13702 412 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 GPR19Q15760 415 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 FKBP15Q5T1M5 1219 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 LRRTM4Q86VH4 590 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 NEK11Q8NG66 645 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 GPR150Q8NGU9 434 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 HSPH1Q92598 858 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 INPP5DQ92835 1189 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 MARVELD3Q96A59 401 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 PCDH18Q9HCL0 1135 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 TCFL5Q9UL49 500 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 MMP2P08253 660 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 RAB40ALP0C0E4 278 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 IDSP22304 550 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 FECHP22830 423 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 CES1P23141 567 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 PCK1P35558 622 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 VAV2P52735 878 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 BOLA3Q53S33 107 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 ALS2CLQ60I27 953 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 MYO7BQ6PIF6 2116 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 MED25Q71SY5 747 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 KMT5CQ86Y97 462 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 DSELQ8IZU8 1212 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 GLYATL1Q969I3 302 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 LRFN5Q96NI6 719 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 NLNQ9BYT8 704 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 KCND1Q9NSA2 647 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 C5AR2Q9P296 337 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 SNX7Q9UNH6 387 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa14.7□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.69□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 ARHGAP10A1A4S6 786 aa14.69□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 MEN1O00255 615 aa14.69□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 MATN3O15232 486 aa14.69□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 HLA-DQB2P05538 268 aa14.69□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 SERPINB6P35237 376 aa14.69□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 UBE2HP62256 183 aa14.69□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 TUBB4BP68371 445 aa14.69□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 HSD11B2P80365 405 aa14.69□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 MMRN1Q13201 1228 aa14.69□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 ATP1A4Q13733 1029 aa14.69□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 TUBB2AQ13885 445 aa14.69□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.69□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 LRRC49Q8IUZ0 686 aa14.69□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
IFITM3-201ENST00000399808 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms