RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 GLDCP23378 1020 aa8.59□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CRATP43155 626 aa8.59□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ATP6V0D1P61421 351 aa8.59□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PTGR1Q14914 329 aa8.59□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF678Q5SXM1 525 aa8.59□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 RETSATQ6NUM9 610 aa8.59□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.59□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC2A13Q96QE2 648 aa8.59□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SH3GL1Q99961 368 aa8.59□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 KPNA6O60684 536 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 VPS4BO75351 444 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 FMO3P31513 532 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SCNN1AP37088 669 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 GATMP50440 423 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PKDCCQ504Y2 493 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 UNC50Q53HI1 259 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 GALNT10Q86SR1 603 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SLCO6A1Q86UG4 719 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC15A3Q8IY34 581 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 LIX1Q8N485 282 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CAPN10Q9HC96 672 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SMOXQ9NWM0 555 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 OTCP00480 354 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 KRT8P05787 483 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 APLP1P51693 650 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 NDST2P52849 883 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 LSAMPQ13449 338 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 OR4D1Q15615 310 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 MS4A13Q5J8X5 152 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 TTC23LQ6PF05 361 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 OR52B6Q8NGF0 335 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 TMBIM1Q969X1 311 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 MUS81Q96NY9 551 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 HAPLN3Q96S86 360 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 TPK1Q9H3S4 243 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 OCEL1Q9H607 264 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 LMCD1Q9NZU5 365 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 C3orf18Q9UK00 162 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 USP22Q9UPT9 525 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM247A6NEH6 219 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 NME4O00746 187 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PRKD3O94806 890 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 TFAP2AP05549 437 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 FYNP06241 537 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CAPN3P20807 821 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 CAPGP40121 348 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 POLD2P49005 469 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 HPCAP84074 193 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 MEP1AQ16819 746 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 FGD3Q5JSP0 725 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SH2D5Q6ZV89 423 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 AHSA2Q719I0 299 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 RRM2BQ7LG56 351 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PAGE2Q7Z2X7 111 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 NUDT8Q8WV74 236 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PTERQ96BW5 349 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 FOPNLQ96NB1 174 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 BBIP1A8MTZ0 92 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PLOD2O00469 737 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 SEC24AO95486 1093 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ANXA5P08758 320 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 OXTRP30559 389 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 GJA5P36382 358 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PIK3R6Q5UE93 754 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 MSANTD2Q6P1R3 559 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 GPR180Q86V85 440 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRC49Q8IUZ0 686 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 BIRC7Q96CA5 298 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 OSBPL2Q9H1P3 480 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 REEP1Q9H902 201 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 PLAC1Q9HBJ0 212 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ASB3Q9Y575 518 aa8.57□□□□□ -1.04
ANKRD42-202ENST00000393389 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms