RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UBR7Q8N806 425 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C4orf32Q8N8J7 132 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PARD3BQ8TEW8 1205 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARHGAP45Q92619 1136 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RYR2Q92736 4967 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM143Q96AN5 459 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GCC1Q96CN9 775 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 VPS45Q9NRW7 570 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TOMM22Q9NS69 142 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SOHLH2Q9NX45 425 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR6C3Q9NZP0 311 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SEL1LQ9UBV2 794 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PPT2Q9UMR5 302 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MTMR6Q9Y217 621 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PLXNA3P51805 1871 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BLACEA4D250 179 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IQCA1LA6NCM1 817 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM157AC9JC47 383 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PLOD2O00469 737 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WNT9BO14905 357 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TUSC2O75896 110 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RECKO95980 971 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RENP00797 406 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LDHBP07195 334 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HSD3B1P14060 373 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CYP2A7P20853 494 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 S1PR1P21453 382 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TNFSF9P41273 254 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DGKEP52429 567 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GALCP54803 685 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM193AP78312 1265 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZBED6P86452 979 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LGALS3BPQ08380 585 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MGAT2Q10469 447 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BLMHQ13867 455 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF234Q14588 700 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ERAP2Q6P179 960 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPARTQ8N0X7 666 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FTMTQ8N4E7 242 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM46DQ8NEK8 389 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 JAKMIP2Q96AA8 810 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PHF21AQ96BD5 680 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAF2Q96CS3 445 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CMKLR1Q99788 373 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RHNO1Q9BSD3 238 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ADI1Q9BV57 179 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FUT8Q9BYC5 575 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HIPK3Q9H422 1215 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PIGVQ9NUD9 493 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM9Q9P0T7 183 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC9A2Q9UBY0 812 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RSPH14Q9UHP6 348 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ASAP1Q9ULH1 1129 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MOKQ9UQ07 419 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CNTN6Q9UQ52 1028 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ALPK3Q96L96 1907 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RNF213Q63HN8 5207 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KAT6BQ8WYB5 2073 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CARNS1A5YM72 827 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CXorf65A6NEN9 183 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FRG2CA6NGY1 282 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HEPACAM2A8MVW5 462 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF487B1APH4 448 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 hCG_1984214I3L0E3 225 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 M0QYG6 137 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CHL1O00533 1208 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HSPB6O14558 160 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNHIT1O43257 154 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CHTF8P0CG12 524 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TFPIP10646 304 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TCF3P15923 654 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC9A1P19634 815 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FUT3P21217 361 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PCGF2P35227 344 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 AHRP35869 848 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ITGAEP38570 1179 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TSFMP43897 325 aaKnown RBP-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRKAA2P54646 552 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PAX9P55771 341 aa-2.06□□□□□ -2.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms