RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 OR4D2P58180 307 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 KCNAB2Q13303 367 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 SPATS1Q496A3 300 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 PAGE3Q5JUK9 113 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 COLEC12Q5KU26 742 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 TNIP3Q96KP6 325 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 SLC52A3Q9NQ40 469 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 IL37Q9NZH6 218 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 DCLK1O15075 740 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 MFN2O95140 757 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 MTHFRP42898 656 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 SLC25A52Q3SY17 297 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 AGAP9Q5VTM2 703 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 KIAA0319Q5VV43 1072 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PAQR9Q6ZVX9 377 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 SLC22A15Q8IZD6 547 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 SVOPQ8N4V2 548 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16.64■□□□□ 0.253e-10■■■■□ 21.3
GDE1-201ENST00000353258 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 HSFY1Q96LI6 401 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 CNGB3Q9NQW8 809 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ITM2CQ9NQX7 267 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 GPSM3Q9Y4H4 160 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ASPDHA6ND91 283 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PPP6CO00743 305 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PTGESO14684 152 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 SNX2O60749 519 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 POLD2P49005 469 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 RACK1P63244 317 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PKN3Q6P5Z2 889 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 BEND5Q7L4P6 421 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 TUBGCP3Q96CW5 907 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa16.64■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 G3V2T6 193 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PRSS23O95084 383 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 MATN4O95460 622 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 HGFP14210 728 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 DIO3P55073 304 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 FOXA1P55317 472 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 SH3BP2P78314 561 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 CDC42EP1Q00587 391 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 CCDC81Q6ZN84 652 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 CLYBLQ8N0X4 340 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 MCFD2Q8NI22 146 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 TWIST2Q8WVJ9 160 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 YIPF6Q96EC8 236 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 TRMOQ9BU70 441 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 DUSP16Q9BY84 665 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PIGVQ9NUD9 493 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 FAM72CH0Y354 149 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 HPRP00739 348 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 KCNE1P15382 129 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 NPR3P17342 541 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ERCC2P18074 760 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PSMB9P28065 219 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 PNPLA4P41247 253 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ISL1P61371 349 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 FAM72AQ5TYM5 149 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 SPRYD7Q5W111 196 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 GLYATQ6IB77 296 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 FAM72DQ6L9T8 149 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 CLEC20AQ6ZU45 233 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 C11orf74Q86VG3 221 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 FAM72BQ86X60 149 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 SLC22A9Q8IVM8 553 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 NPWQ8N729 165 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 CNIH3Q8TBE1 160 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 MCOLN3Q8TDD5 553 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 FIG4Q92562 907 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 TEX37Q96LM6 180 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 FEM1AQ9BSK4 669 aa16.63■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 A0A1W2PP18 115 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 DAB1O75553 588 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 IMPDH1P20839 514 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 TKTL1P51854 596 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 POU4F1Q01851 419 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 CHRNEQ04844 493 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 COQ5Q5HYK3 327 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 ZNF678Q5SXM1 525 aa16.62■□□□□ 0.25
GDE1-201ENST00000353258 SIGIRRQ6IA17 410 aa16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms