RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348227.4

WDR54-201, Transcript of WD repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene WDR54, Length 1,147 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR54-201ENST00000348227 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.72□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 GPR150Q8NGU9 434 aa14.72□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 OR4C6Q8NH72 309 aa14.72□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 LPGAT1Q92604 370 aa14.72□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 CERS2Q96G23 380 aa14.72□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.72□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.72□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa14.72□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.72□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 PRSS21Q9Y6M0 314 aa14.72□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.72□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 ADAMTS20P59510 1910 aa14.72□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 PTPRBP23467 1997 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 MAGEB16A2A368 324 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 EML2O95834 649 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 MYBL2P10244 700 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 MSH3P20585 1137 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 GRK6P43250 576 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 ARHGAP8P85298 464 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 GTF2H3Q13889 308 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 LRP8Q14114 963 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 PROX2Q3B8N5 592 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 ZNF789Q5FWF6 425 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 NEPROQ6NW34 567 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 CCDC25Q86WR0 208 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 CILP2Q8IUL8 1156 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 KYQ8NBH2 561 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 SGF29Q96ES7 293 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 FMO2Q99518 471 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 FOXP3Q9BZS1 431 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 P2RY12Q9H244 342 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 KCNK6Q9Y257 313 aa14.71□□□□□ -0.05
WDR54-201ENST00000348227 YY2O15391 372 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 SH3BP5O60239 455 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 SLU7O95391 586 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 ERVK-10P10266 1014 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 TTPAP49638 278 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 GPX6P59796 221 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 MPP1Q00013 466 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 DMPKQ09013 629 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 CUL1Q13616 776 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 ELOCQ15369 112 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 CERS6Q6ZMG9 384 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 CCNJLQ8IV13 435 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 EID2Q8N6I1 236 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 C9orf72Q96LT7 481 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 GSDMCQ9BYG8 508 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 TAAR2Q9P1P5 351 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 GPR34Q9UPC5 381 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 GPSM3Q9Y4H4 160 aa14.7□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 CFAP99D6REC4 459 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 TPP1O14773 563 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 KMOO15229 486 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 SIGLEC6O43699 453 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 NOBOXO60393 691 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 CTSEP14091 401 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 TNFRSF8P28908 595 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 SSTR1P30872 391 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 ACTR1BP42025 376 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 NSG1P42857 185 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 ACTR1AP61163 376 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 INSCQ1MX18 579 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 INAVAQ3KP66 663 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 CAPN12Q6ZSI9 719 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 SLC35F3Q8IY50 421 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 HEXDCQ8WVB3 486 aa14.69□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 PATE1Q8WXA2 126 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms