RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 FOXM1Q08050 763 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 DENND5AQ6IQ26 1287 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 IQCF2Q8IXL9 164 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 UNC5BQ8IZJ1 945 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 CAPNS2Q96L46 248 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 DSN1Q9H410 356 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 PGRMC2O15173 223 aa22.18■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 NR2F6P10588 404 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 CASP9P55211 416 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 CPT1BQ92523 772 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 AZIN2Q96A70 460 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 ELOVL2Q9NXB9 296 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 NUDT4Q9NZJ9 180 aa22.18■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 REP15Q6BDI9 236 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 FAM131AQ6UXB0 335 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 HID1Q8IV36 788 aa22.18■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.18■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD46Q86W74 232 aa22.18■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 POLE3Q9NRF9 147 aa22.17■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.17■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 HEPHQ9BQS7 1158 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 PRKCZQ05513 592 aa22.17■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 PJA1Q8NG27 643 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1B0GVM2 712 aa22.16■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 TTKP33981 857 aa22.16■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC1A5Q15758 541 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 SPRYD7Q5W111 196 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 SLC30A6Q6NXT4 461 aa22.16■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 ACLYP53396 1101 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 ABCB9Q9NP78 766 aa22.16■■□□□ 1.14
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PTPRM-201ENST00000332175 IL12AP29459 219 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 GPR65Q8IYL9 337 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 MATN3O15232 486 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRM-201ENST00000332175 PPLO60437 1756 aa22.16■■□□□ 1.14
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