RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328596.10

TNFRSF18-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 18, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF18, Length 851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18-201ENST00000328596 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 CMKLR1Q99788 373 aa20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 DPYSL5Q9BPU6 564 aa20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 LOXL2Q9Y4K0 774 aa20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 ADAMTS20P59510 1910 aa20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 AGAP14A8MT82 685 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 PDZK1P1A8MUH7 402 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 FGGP02679 453 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 JMJD7P0C870 316 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 MSH3P20585 1137 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 IDSP22304 550 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 AKT1P31749 480 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 ABCG1P45844 678 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 CTSCP53634 463 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 TMPRSS15P98073 1019 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 WASH2PQ6VEQ5 465 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 CLEC14AQ86T13 490 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 AMZ2Q86W34 360 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 CCDC89Q8N998 374 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 OR4D9Q8NGE8 314 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 WASH6PQ9NQA3 447 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 LHX6Q9UPM6 363 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 CHD6Q8TD26 2715 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 OR2AG2A6NM03 316 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 DUX1O43812 170 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 POP7O75817 140 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 HGFP14210 728 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 ITGALP20701 1170 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 RPL10P27635 214 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 ITPKBP27987 946 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 CSF2RBP32927 897 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 LIMK2P53671 638 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 EPHA4P54764 986 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 CFHR1Q03591 330 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 DMPKQ09013 629 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 POU6F1Q14863 301 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 AGAP9Q5VTM2 703 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 SNX20Q7Z614 316 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 ULK4Q96C45 1275 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 CRLS1Q9UJA2 301 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 SNX12Q9UMY4 172 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 BPTFQ12830 3046 aa20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 E7EVH7 732 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 CES2O00748 559 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 SUN1O94901 812 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 ETS1P14921 441 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 BRAFP15056 766 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 SLC19A1P41440 591 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 LMAN1P49257 510 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 SEPT6Q14141 434 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 TMEM71Q6P5X7 295 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 PRUNE1Q86TP1 453 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 TRIM48Q8IWZ4 208 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 OR52K1Q8NGK4 314 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 STYXQ8WUJ0 223 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 SGF29Q96ES7 293 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 CCDC74BQ96LY2 380 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 ZMYND15Q9H091 742 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 UCK1Q9HA47 277 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 PAK5Q9P286 719 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 PISDQ9UG56 409 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF18-201ENST00000328596 LILRA5A6NI73 299 aa20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF18-201ENST00000328596 H7C0S8 307 aa20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF18-201ENST00000328596 AGRPO00253 132 aa20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF18-201ENST00000328596 CCL22O00626 93 aa20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF18-201ENST00000328596 VIPP01282 170 aa20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF18-201ENST00000328596 THRAP10827 490 aa20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF18-201ENST00000328596 TCP1P17987 556 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms