RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 PRR35P0CG20 571 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 NCK1P16333 377 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 SP3Q02447 781 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 ERMP1Q7Z2K6 904 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 CARM1Q86X55 608 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 BHMTQ93088 406 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 EID2BQ96D98 161 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM74Q96NL1 305 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 PIF1Q9H611 641 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 COMMD8Q9NX08 183 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 DHRS12A0PJE2 317 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 KLK8O60259 260 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 CTPS1P17812 591 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 IL2P60568 153 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 TWF1Q12792 350 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 NFYCQ13952 458 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 GPSM1Q86YR5 675 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 OSBPL11Q9BXB4 747 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 ARMC1Q9NVT9 282 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 AIG1Q9NVV5 245 aa16.19■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 E2F3O00716 465 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 C1RP00736 705 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 COL6A1P12109 1028 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM259Q4ZIN3 620 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 LHX8Q68G74 356 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 TTC30BQ8N4P2 665 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 SLC43A3Q8NBI5 491 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 ZUFSPQ96AP4 578 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM125Q96AQ2 219 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 SCN5AQ14524 2016 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1B0GVM2 712 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1W2PP18 115 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 E5RI56 91 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 STX16O14662 325 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 ARPC2O15144 300 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 SNX2O60749 519 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 BMP2P12643 396 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 HSD17B1P14061 328 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 IL12AP29459 219 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 CA5AP35218 305 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 TTPAP49638 278 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 CLCN2P51788 898 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 USP41Q3LFD5 358 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 KCTD21Q4G0X4 260 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 XKR7Q5GH72 579 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 ADGRF1Q5T601 910 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 EPHX4Q8IUS5 362 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 CBR4Q8N4T8 237 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 ANKFN1Q8N957 763 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 OR6K2Q8NGY2 324 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 CAAP1Q9H8G2 361 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 GID8Q9NWU2 228 aa16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 GNAO1P09471 354 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 ALPIP09923 528 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 UROSP10746 265 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 KCNK10P57789 538 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 ERVPABLB-1P60509 514 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 SMARCB1Q12824 385 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 RCAN2Q14206 197 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 AAK1Q2M2I8 961 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 TIGD2Q4W5G0 525 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 NHSL2Q5HYW2 709 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 OGFOD2Q6N063 350 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 KLHL35Q6PF15 583 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 KIAA2013Q8IYS2 634 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 VN1R3Q9BXE9 311 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 ADGRE3Q9BY15 652 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 OLAHQ9NV23 265 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 NDUFA13Q9P0J0 144 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 H0YJX3 145 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 ARVCFO00192 962 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 ITGB6P18564 788 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 PSMA3P25788 255 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 GSK3BP49841 420 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 TGFBIQ15582 683 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 PPP4R4Q6NUP7 873 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 LETMD1Q6P1Q0 360 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 PRMT9Q6P2P2 845 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 NPAS4Q8IUM7 802 aa16.17■□□□□ 0.18
SHQ1-201ENST00000325599 CARNMT1Q8N4J0 409 aa16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms