RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 SAGP10523 405 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 CCR10P46092 362 aa23.95■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF697Q5TEC3 545 aa23.95■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 COQ10BQ9H8M1 238 aa23.95■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGEB3O15480 346 aa23.95■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 ATG13O75143 517 aa23.95■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 HSPA7P48741 367 aa23.95■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 CLDN25C9JDP6 229 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 PIP5K1BO14986 540 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 ASGR1P07306 291 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 OGNP20774 298 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 SPAM1P38567 509 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAM17P78536 824 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM156AQ8NDB6 213 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 HAVCR1Q96D42 359 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 TBATAQ96M53 351 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 RRAGCQ9HB90 399 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 H3BNH8 94 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 RTL4Q6ZR62 310 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNS3Q9BQ31 491 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 CNPPD1Q9BV87 410 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 GRHL1Q9NZI5 618 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 GMIPQ9P107 970 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 COL1A2P08123 1366 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 NPHS1O60500 1241 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 IFNA6P05013 189 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGDIBP52566 201 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR142Q7Z601 462 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 CDADC1Q9BWV3 514 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 RMI1Q9H9A7 625 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 MIOSQ9NXC5 875 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 ART5Q96L15 291 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 IKZF2Q9UKS7 526 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 POMPQ9Y244 141 aa23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A0X1KG70 313 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 NDUFS2O75306 463 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 GRM6O15303 877 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 RHOQP17081 205 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 FRMD7Q6ZUT3 714 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA22Q8NHS9 363 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 TTYH3Q9C0H2 523 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 GMEB1Q9Y692 573 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 hCG_2039718K7EN88 272 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGEF4Q9NR80 690 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 PRODHO43272 600 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 CCNB2O95067 398 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 MYBPC3Q14896 1274 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 CNPY1Q3B7I2 92 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 FEM1AQ9BSK4 669 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAMDEC1O15204 470 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 S100A6P06703 90 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 TAF10Q12962 218 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF460Q14592 562 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 RGL4Q8IZJ4 473 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 PYROXD2Q8N2H3 581 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 OR10A6Q8NH74 314 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 PIK3R3Q92569 461 aa23.93■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 CCR3P51677 355 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 SULT2A1Q06520 285 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDH1Q08174 1060 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 C11orf65Q8NCR3 313 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 PPTC7Q8NI37 304 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM27Q9HBJ8 222 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 H3BM21 787 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF12P17014 697 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 ITPKBP27987 946 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 HTR7P34969 479 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPN9P43378 593 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC5A3P53794 718 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 CDH12P55289 794 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 OR10H5Q8NGA6 315 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 TOP1MTQ969P6 601 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 C11orf16Q9NQ32 467 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 GIN1Q9NXP7 522 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 AGLP35573 1532 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 CXCR6O00574 342 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 GOT2P00505 430 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 OGFOD2Q6N063 350 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 OR8H1Q8NGG4 311 aa23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 IRGQQ8WZA9 623 aa23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms