RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 MROH2AA6NES4 1674 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM172BPA6NC97 362 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 ENPEPQ07075 957 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 MSS51Q4VC12 460 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 CCDC157Q569K6 752 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINGO4Q6UY18 593 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 DAW1Q8N136 415 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 SUSD6Q92537 303 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 PPP1R14BQ96C90 147 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 GPR20Q99678 358 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 GSDMCQ9BYG8 508 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 MARCH7Q9H992 704 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 TBC1D3BA6NDS4 549 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 PEX10O60683 326 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 FUT4P22083 530 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 FMO3P31513 532 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 RPL9P32969 192 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 TSTD2Q5T7W7 516 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 OLFML2AQ68BL7 652 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 PKP2Q99959 881 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 CNPPD1Q9BV87 410 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 RAI2Q9Y5P3 530 aa13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 CXCR6O00574 342 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 NPHS1O60500 1241 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 GOT2P00505 430 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 CCNCP24863 283 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A088AWK7 358 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 SCELO95171 688 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 ARL2P36404 184 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC1A2P43004 574 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 SFT2D3Q587I9 215 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 ERICH5Q6P6B1 374 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 XKR5Q6UX68 686 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 LRP10Q7Z4F1 713 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 LIX1Q8N485 282 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 POLE3Q9NRF9 147 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 MALT1Q9UDY8 824 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 HIST1H2ABP04908 130 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 RPIAP49247 311 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 NOMO2Q5JPE7 1267 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 STYXQ8WUJ0 223 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 HIST1H2ACQ93077 130 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 EBPLQ9BY08 206 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF224Q9NZL3 707 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR10H1Q9Y4A9 318 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 PCDH1Q08174 1060 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLCO2A1Q92959 643 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 BTN2A3PQ96KV6 586 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPACA7Q96KW9 195 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 GON4LQ3T8J9 2241 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 FADS2P1A8MWK0 482 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 CLDN9O95484 217 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 VNN1O95497 513 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 IFNA16P05015 189 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 NAE1Q13564 534 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 NEK5Q6P3R8 708 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 MYO19Q96H55 970 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 LPIN3Q9BQK8 851 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC25A51Q9H1U9 297 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 DNAJC11Q9NVH1 559 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 PEX16Q9Y5Y5 336 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 IRAK3Q9Y616 596 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 C11orf65Q8NCR3 313 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 FCRL4Q96PJ5 515 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 PDZD7Q9H5P4 517 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 SEMA3GQ9NS98 782 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 LRRC42Q9Y546 428 aa13.48□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 LMO2P25791 158 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 DUSP4Q13115 394 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 RAPSNQ13702 412 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 KCNA10Q16322 511 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF516Q92618 1163 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 SSR2P43308 183 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 C2orf80Q0P641 193 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 GTF2H2Q13888 395 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 C9orf64Q5T6V5 341 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 MOB2Q70IA6 237 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 PTF1AQ7RTS3 328 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRPV1Q8NER1 839 aa13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 ASB9Q96DX5 294 aa13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms