RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 FPGTO14772 594 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 CSNK2BP67870 215 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 VPS26BQ4G0F5 336 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 PGM3O95394 542 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 CLHC1Q8NHS4 586 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 GULP1Q9UBP9 304 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 SCML2Q9UQR0 700 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 TIPRLO75663 272 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 MFN2O95140 757 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 LIPEQ05469 1076 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 LGALS3BPQ08380 585 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 DEF8Q6ZN54 512 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 PIK3C3Q8NEB9 887 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 SRRDQ9UH36 339 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 AK5Q9Y6K8 562 aa20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 H3BNH8 94 aa20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 CCL22O00626 93 aa20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 SF1Q15637 639 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 FADS3Q9Y5Q0 445 aa20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 GCNT6Q5T4J0 391 aa20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF671Q8TAW3 534 aa20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 FAM159BA6NKW6 160 aa20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 CHIT1Q13231 466 aa20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 UBR7Q8N806 425 aa20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 RNF39Q9H2S5 420 aa20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 NEK6Q9HC98 313 aa20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 IL6P05231 212 aa20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 PRG2P13727 222 aa20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.16■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 UGT2B17O75795 530 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 OR4F21O95013 312 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 OLR1P78380 273 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 SPPL2CQ8IUH8 684 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 ADAMTS15Q8TE58 950 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 DCAKDQ8WVC6 231 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 MYOCQ99972 504 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 ALG2Q9H553 416 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 YIPF1Q9Y548 306 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 HLA-DQB2P05538 268 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 CAPN1P07384 714 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 CMPK1P30085 196 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 MAPK10P53779 464 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 ERVK-21P61565 698 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 COMMD2Q86X83 199 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 RAB23Q9ULC3 237 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF24P17028 368 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 CCNFP41002 786 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 C2orf80Q0P641 193 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 RACGAP1Q9H0H5 632 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 ATG10Q9H0Y0 220 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 NR2F6P10588 404 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 RALGDSQ12967 914 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 DPY19L1Q2PZI1 675 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 RALGPS1Q5JS13 557 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 GJD3Q8N144 294 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 C11orf65Q8NCR3 313 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 S100ZQ8WXG8 99 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 AZIN2Q96A70 460 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 ABCG8Q9H221 673 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 C1orf109Q9NX04 203 aa20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 OR2AG2A6NM03 316 aa20.14■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 PIP5K1BO14986 540 aa20.14■□□□□ 0.82
LRIG1-201ENST00000273261 ERN1O75460 977 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms