RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 HES3Q5TGS1 186 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 CES3Q6UWW8 571 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 DET1Q7L5Y6 550 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 PPIL6Q8IXY8 311 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 OR6C4Q8NGE1 309 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 MFSD3Q96ES6 412 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 COPS8Q99627 209 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 LRIT1Q9P2V4 623 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 SOX13Q9UN79 622 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 MSRB2Q9Y3D2 182 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 UNC13CQ8NB66 2214 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PQM1 296 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 TP73O15350 636 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 TTI1O43156 1089 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 BRAFP15056 766 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 PNLIPP16233 465 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 AKT1P31749 480 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 SARNPP82979 210 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 DMPKQ09013 629 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 CAMK2BQ13554 666 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 NR1D2Q14995 579 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 INSCQ1MX18 579 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 BCL7AQ4VC05 210 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 FNBP1LQ5T0N5 605 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R42Q7RTR8 314 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 OR4L1Q8NH43 312 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 MAPK15Q8TD08 544 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 SLC37A2Q8TED4 501 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 SIGLEC10Q96LC7 697 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 RUNDC3BQ96NL0 473 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 KRT12Q99456 494 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 TRIM51Q9BSJ1 452 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 ASIC3Q9UHC3 531 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa21.92■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 B4GAT1O43505 415 aa21.91■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 SNX2O60749 519 aa21.91■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 MT-CO3P00414 261 aa21.91■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 F3P13726 295 aa21.91■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 CCL7P80098 99 aa21.91■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 AFTPHQ6ULP2 937 aa21.91■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa21.91■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 WASH2PQ6VEQ5 465 aa21.91■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 AMZ2Q86W34 360 aa21.91■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 GALNT15Q8N3T1 639 aa21.91■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa21.91■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 WASH6PQ9NQA3 447 aa21.91■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 WDR37Q9Y2I8 494 aa21.91■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 PRSS21Q9Y6M0 314 aa21.91■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 CHD8Q9HCK8 2581 aa21.9■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 KCNJ13O60928 360 aa21.9■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 FASLGP48023 281 aa21.9■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 PRLHRP49683 370 aa21.9■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 ARMC3Q5W041 872 aa21.9■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 CLDN19Q8N6F1 224 aa21.9■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 OR6P1Q8NGX9 317 aa21.9■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 HEXDCQ8WVB3 486 aa21.9■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 SDR42E2A6NKP2 422 aa21.89■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 RPL10P27635 214 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 NFE2L1Q14494 772 aa21.89■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 ITIH4Q14624 930 aa21.89■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 CLCA4Q14CN2 919 aa21.89■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 AGAP9Q5VTM2 703 aa21.89■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 IZUMO3Q5VZ72 239 aa21.89■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 METRNLQ641Q3 311 aa21.89■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 SPRED1Q7Z699 444 aa21.89■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 OR2L2Q8NH16 312 aa21.89■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 GATA6Q92908 595 aa21.89■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 DCUN1D1Q96GG9 259 aa21.89■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa21.89■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 MGAT4DA6NG13 374 aa21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 OR1I1O60431 355 aa21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 RALBP11234 206 aa21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 JUPP14923 745 aa21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 SLC19A1P41440 591 aa21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 PDX1P52945 283 aa21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 DRG2P55039 364 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms