RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 IRF9Q00978 393 aa22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 PPARDQ03181 441 aa22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 TMEFF1Q8IYR6 380 aa22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 CADM4Q8NFZ8 388 aa22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 KCNJ9Q92806 393 aa22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 TSPAN17Q96FV3 270 aa22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 SLC30A3Q99726 388 aa22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 TAS2R13Q9NYV9 303 aa22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 DMTF1Q9Y222 760 aa22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 WDFY4Q6ZS81 3184 aa22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 BRAFP15056 766 aa22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 CCNFP41002 786 aa22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 LONP2Q86WA8 852 aa22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 CNPY4Q8N129 248 aa22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 HSPA12BQ96MM6 686 aa22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 PCED1AQ9H1Q7 454 aa22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 ACTL7BQ9Y614 415 aa22.68■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 H3BMM5 538 aa22.67■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 MPOP05164 745 aa22.67■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 SLC18A2Q05940 514 aa22.67■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 GTF2H3Q13889 308 aa22.67■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 TMEM220Q6QAJ8 160 aa22.67■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 TMEM207Q6UWW9 146 aa22.67■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 NAPRTQ6XQN6 538 aa22.67■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 GIMAP7Q8NHV1 300 aa22.67■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 ACMSDQ8TDX5 336 aa22.67■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 GPAMQ9HCL2 828 aa22.67■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 FAM53CQ9NYF3 392 aa22.67■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 TMEM202A6NGA9 273 aa22.66■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 MEI4A8MW99 385 aa22.66■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 VEGFDO43915 354 aa22.66■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 AP2A2O94973 939 aa22.66■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 MAOBP27338 520 aa22.66■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 CRABP2P29373 138 aa22.66■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 OAS2P29728 719 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 NUDT1P36639 197 aa22.66■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 CLCN7P51798 805 aa22.66■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 PFN3P60673 137 aa22.66■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa22.66■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 CD200R1Q8TD46 325 aa22.66■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 SLC6A18Q96N87 628 aa22.66■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 TLK1Q9UKI8 766 aa22.66■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa22.66■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 ANKRD12Q6UB98 2062 aa22.65■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 GPR37L1O60883 481 aa22.65■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 PRLHRP49683 370 aa22.65■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 TPRG1LQ5T0D9 272 aa22.65■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 PAQR3Q6TCH7 311 aa22.65■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 CRTC3Q6UUV7 619 aa22.65■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 ARMCX6Q7L4S7 300 aa22.65■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 BANPQ8N9N5 519 aa22.65■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 PANX3Q96QZ0 392 aa22.65■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 SELENOSQ9BQE4 189 aa22.65■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 FBXO4Q9UKT5 387 aa22.65■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 PRKAB1Q9Y478 270 aa22.65■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 A6NNZ2 444 aa22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 LILRB5O75023 590 aa22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 CD9P21926 228 aa22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 CD27P26842 260 aa22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 SPATA6LQ8N4H0 392 aa22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 OR13H1Q8NG92 308 aa22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 ANKRD49Q8WVL7 239 aa22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 APOPT1Q96IL0 206 aa22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 CABS1Q96KC9 395 aa22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 POPDC3Q9HBV1 291 aa22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 KCNK9Q9NPC2 374 aa22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 FAM8A1Q9UBU6 413 aa22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 ACOT9Q9Y305 439 aa22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.64■■□□□ 1.22
USF2-201ENST00000222305 QSOX1O00391 747 aa22.64■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 COPEO14579 308 aa22.64■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 CCR7P32248 378 aa22.64■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 KIAA1024LP59773 190 aa22.64■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 DLG1Q12959 904 aa22.64■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 NFATC4Q14934 902 aa22.64■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa22.64■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 BCL7AQ4VC05 210 aa22.64■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 UGT3A1Q6NUS8 523 aa22.64■■□□□ 1.21
USF2-201ENST00000222305 Q6ZSR6 202 aa22.64■■□□□ 1.21
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